求助：含锕系元素配合物计算论文的提问?

wangzh

[ 本帖最后由 wangzh 于 2023-3-17 16:03 编辑 ]\n\n
1.论文中这个配体的结构是怎么得到的？按照博文molclus+gentor构象搜索的方法，应该得到几个能量最低的构象，这里也是这样得到的嘛？这四个构型是能量最低的四个吗？如果不是，为什么选择这样的四个构型？2.论文DTF部分的计算中，金属与配体配位，加了硝酸根离子，是因为实验在硝酸溶液中进行的，那么这里加的硝酸根是否考虑了硝酸浓度？还是说默认这里就是浓硝酸？
2.对于这样的结构，需要考虑质子化吗？如果考虑，应该怎么操作？   答：Et-Tol-DAPhen keeps strong stability in high acidity. According to the Lange’s Handbook of Chemistry Version 15th, the pKa of 1,10-Phenanthroline is 4.86  thus easy to be protonated. However, the electron-withdrawing acetamide moieties exhibit a relatively low pKa value of −0.37 [14] which strongly decrease the basicity of the ligand. As a consequence, Et-Tol-DAPhen is difficult to be protonated and shows strong stability in highly acidic media, exhibiting a significant potential to adapt the acidity in an industrial scale.
3.对于第二个问题的答案，可以解释在图2上面吗？因为图2中磺酸是不是带质子的，除非做强酸性溶液，否则磺酸很可能会以电离态为主，磺酸的pKa为1.92(at 25℃)。

sobereva

提问时不要用“按照博文构象搜索的方法”这种描述，仔细看下文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

用molclus+gentor（http://www.keinsci.com/research/molclus.html）做构象搜索，很容易得到图中的结构

帖子发完了好好检查一遍，不要出现莫名其妙的字符、莫名其妙的底色，有问题尽快编辑帖子修改

wangzh

sobereva 发表于 2023-3-17 13:53
提问时不要用“按照博文构象搜索的方法”这种描述，仔细看下文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描 ...

感谢老师指点，非常抱歉，我重新编辑了一下