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[GROMACS] 求助,利用gromacs做能量最小化遇到的问题

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我在利用gromacs做石墨烯的能量最小化时,遇到了报错,意思是磁盘空间不足,我在网上找到的解决办法是修改mdp文件里面的内容,按照其他网站说法修改后还是报错。同时,我发现log文件等也是不断产生,我同学做蛋白质时只产生了一个log完整的记录了过程,我猜测可能是报错后就不断产生又不断报错又重新产生。下面是遇到问题和源文件。

QQ图片20230826203344.jpg (77.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

QQ图片20230826203344.jpg

vac.mdp

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#nvt.log.67#

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gra_wat.gro

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gra_wat.top

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管理员

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2#
发表于 Post on 2023-8-26 21:23:20 | 只看该作者 Only view this author
腾硬盘空间,或者找管理员申请更多硬盘配额。跟mdp根本没直接关系,别被网上乱七八糟的说法误导
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-26 21:52:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-26 21:23
腾硬盘空间,或者找管理员申请更多硬盘配额。跟mdp根本没直接关系,别被网上乱七八糟的说法误导

好的好的,谢谢老师。

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