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[Gaussian/gview] 关于linux系统的高斯和高斯-view

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谁可以提供关于高斯09和高斯-view在linux系统下的安装流程呀,还有这个软件,我有win系统的软件,没有linux系统,谁能提供一下呀,非常感谢!!!!

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发表于 Post on 2015-5-11 18:40:05 | 只看该作者 Only view this author
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g09安装方法:
解压到/sob下
建立/sob/g09/scratch
在/root/.bashrc里加入
export g09root=/sob
export GAUSS_SCRDIR=/sob/g09/scratch
source /sob/g09/bsd/g09.profile
在g09/Default.Route里面设定默认参数,如
-M- 3000MB
-P- 4

如果运行时提示
files in the gaussian directory are world accessible. this must be fixed
则在Gaussian目录下运行chmod 750 -R *


gview配置方法:
export GV_DIR=/sob/gv
export LIBPATH=/sob/gv/lib
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/sob/gv/lib
PATH=$PATH:/sob/gv/

For 64bit system, you may need to install some 32bit package to provide dynamical link libraries.
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-11 22:03:11 | 只看该作者 Only view this author
你好,你说的在/root/.bashrc里加入export g09root=/sob,你指的sob应该是没有解压之前文件的名字,你是以sobereva缩写命名的是吧。
我想问的就是你说的/root/.bashrc我怎么找不到这几个字呢,有的说的是隐藏文件,我看的是没有隐藏呀,你能解释下吗,非常感谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-11 22:06:30 | 只看该作者 Only view this author
你好,我压缩之后显示的文件如下,可是找不到你说的root/.bashrc,为什么呢,非常感谢。

5)6OGLFH`B7[Q_0P($4M)3S.png (42.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 92)

5)6OGLFH`B7[Q_0P($4M)3S.png

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发表于 Post on 2015-5-11 22:21:55 | 只看该作者 Only view this author
.bashrc是每个用户目录下都有的文件,开头的点表明此文件是隐藏文件。
我示例的时候是root用户,所以在/root目录下有那个文件
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-12 09:31:06 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢,我在试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-12 09:36:54 | 只看该作者 Only view this author
你好在请教个问题,你说的root用户,和home用户,分别指的是什么呢,能解释下吗,非常感谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-15 13:36:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-5-11 18:40
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g09安装方法:
解压到/sob下

你好,很感谢你的帮助,安装你的办法我设置过了,可我不知道怎么运行高斯,新手,实在不懂;看到别人写的在win系统下先用高斯-view导出数据,然后复制到linux,可我怎么没办法运行呢,你能给我解释下吗,非常感谢

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发表于 Post on 2015-5-15 14:16:03 | 只看该作者 Only view this author
没有什么home用户,只有root用户和普通用户之分。
直接用g09 < 1.gjf > 1.out即可。gjf文件可以直接用gview保存出来,拷到Linux下即可。
感觉你的Linux基础不好,建议先在网上多找些linux的资料看,有基础的话很多问题不言自明,反之没有基础的话,解释半天也解释不清。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-15 18:31:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-5-15 14:16
没有什么home用户,只有root用户和普通用户之分。
直接用g09 < 1.gjf > 1.out即可。gjf文件可以直接用gvie ...

谢谢你的帮助,我的系统是linux的centos-6.4的,按照你的方法安装高斯的时候,系统上总是显示peimission dentied。为什么没有权限呢,不知道为啥,很感谢你的应助

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发表于 Post on 2015-5-15 18:46:34 | 只看该作者 Only view this author
你用root的话肯定畅通无阻。如果还显示这个,先用chmod 750 *把当前目录文件都变成可执行的
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sobereva 发表于 2015-5-15 18:46
你用root的话肯定畅通无阻。如果还显示这个,先用chmod 750 *把当前目录文件都变成可执行的

你好,我用的就是root用户 ,我按照你说的。好像还是不可以呀,你能解释下吗

F961OUE5V5IJ%8RI0{GWCWJ.png (325.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 83)

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发表于 Post on 2015-5-15 21:52:51 | 只看该作者 Only view this author
要注意空格,我怎么写的你就怎么写,别写
诸如别写750*

而且我前面写了,是g09.profile,别写g09.login
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不好意思,又打扰你了。我按照你给我说的,可怎么会出现这样的呢,我用的是root用户。能在解释下吗,很感谢你的帮助。

WJ}_6QXLX%$$(]D)6LGT~J6.png (332.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 108)

WJ}_6QXLX%$$(]D)6LGT~J6.png

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发表于 Post on 2015-5-16 16:47:55 | 只看该作者 Only view this author
一定要注意空格。所有命令后面都有空格,我写的那些命令该有空格的地方都有空格。空格多了没害处,但不写空格绝对不行。
source后面加上空格
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