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[Gaussian/gview] 求助orca和gaussian联用算ts自定义溶剂部分语句

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发表于 Post on 2023-4-2 14:40:28 | 只看该作者 Only view this author
光添加一行cpcmset一点用处也没有,这又不会写入到自动产生的ORCA输入文件里。一行行阅读orca.sh,搞清楚脚本产生ORCA输入文件的原理,在恰当位置插入溶剂模型设置
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-2 16:32:27 | 只看该作者 Only view this author
谢谢抽空社长回复!orca.sh文件的内容如下:

#Set the number of parallel cores and maximum memory utilized by each core (MB)
nprocs=20
maxcore=1000
#Set calculation level
level="r2SCAN-3c"
#Set parameters for other aspects
numset="tightscf noautostart"
cpcmset="epsilon=32.17 refrac=1.47"
#ORCA executable path
orcapath="..."

read atoms derivs charge spin < $2

if [ $derivs == "2" ] ; then
        task="engrad freq"
elif [ $derivs == "1" ] ; then
        task="engrad"
fi

#Create ORCA input file
echo "Generating mol.inp"
cat > mol.inp <<EOF
! $level $numset $task BOHRS nopop
%pal nprocs $nprocs end
%maxcore $maxcore
* xyz $charge $spin
$(sed -n 2,$(($atoms+1))p < $2 | cut -c 1-72)
*
EOF

#Run ORCA
echo "Running ORCA..."
$orcapath mol.inp > mol.out
echo "ORCA running finished!"

echo "Extracting data from ORCA outputs via extderi"
./extorca $3 $atoms $derivs

mv mol.gbw tmp.gbw -f
rm mol.* mol_* -f
mv tmp.gbw mol.gbw -f

orca创建输入文件应该是这部分吧:
#Create ORCA input file
echo "Generating mol.inp"
cat > mol.inp <<EOF
! $level $numset $task BOHRS nopop
%pal nprocs $nprocs end
%maxcore $maxcore
* xyz $charge $spin
$(sed -n 2,$(($atoms+1))p < $2 | cut -c 1-72)
*
EOF

是把! $level $numset $task BOHRS nopop这个语句添加为这样吗?! $level $cpcmset $numset $task BOHRS nopop
或者该在哪个恰当位置加入溶剂模型设置呢,怎么添加设置?请社长指导一下,谢谢!

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发表于 Post on 2023-4-3 10:01:09 | 只看该作者 Only view this author
thunder55 发表于 2023-4-2 16:32
谢谢抽空社长回复!orca.sh文件的内容如下:

#Set the number of parallel cores and maximum memory ut ...

搞懂ORCA输入文件写法,再了解点shell编程的基础知识,自然就知道了。还不清楚就实际测试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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