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[CP2K] CP2K算非周期体系结构时是否可以对结构进行约束?

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本人是CP2K新手,想利用CP2K跑分子动力学。我想请问一下,CP2K是否可以对非周期性体系进行结构约束,就是把结构约束在一个充满水的球形当中,而不是使用盒子。还望各位不吝赐教!谢谢

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发表于 Post on 2023-4-4 13:02:51 | 只看该作者 Only view this author
看不懂你的目的是什么,也没体系的任何特征描述,没法告诉你怎么实现合理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-4 17:15:30 | 只看该作者 Only view this author
因为我的.cif文件很复杂,所以我想从中截取出一个小片段,将这样一个非周期性的分子结构进行约束处理(为了不让它跑出去)。然后用cp2k跑第一性原理分子动力学来实现它对水同位素的吸附过程。主要是想知道cp2k能不能实现对非周期性结构的约束

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发表于 Post on 2023-4-5 06:58:13 | 只看该作者 Only view this author
learn-GAUSSIAN 发表于 2023-4-4 17:15
因为我的.cif文件很复杂,所以我想从中截取出一个小片段,将这样一个非周期性的分子结构进行约束处理(为了 ...

照常用冻结设置,对周期性和非周期性都完全一样
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-5 09:51:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-5 06:58
照常用冻结设置,对周期性和非周期性都完全一样

谢谢老师

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