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[新手求助] 用Gauss09金属配合物结构优化所得结构是否正确

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本帖最后由 小黑匣 于 2023-4-23 21:11 编辑

使用输入文件1来优化2-甲胺基-氯化铜(Cu(NH2CH3)2Cl2)得到输出文件2(计算最后一步所得结构),请问大神们所得结构是否符合配位化学的理论结构呢?
Cu2 -(NH2CH3)2Cl2-58.out (266.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

Cu2 -(NH2CH3)2Cl2.gjf (1.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)






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发表于 Post on 2023-4-23 22:18:38 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Kmetsch 于 2023-4-23 22:26 编辑

学会熟练使用Molclus进行构相搜索,你的gjf结构不甚合理

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发表于 Post on 2023-4-23 22:42:36 | 只看该作者 Only view this author
不要随便摆个初始结构就优化。初学者的一个常见误区是认为,不管初始结构摆得多么不合理,只要结构优化收敛了没虚频,结果都是可以用的。其实根本没这回事,因为你可能会收敛到一个能量极高的局部极小值点。比如你这个结构就是,由化学常识知第二个CH3NH2和Cu配位应该是热力学有利的,但是因为初始结构不合理,第二个CH3NH2和第一个CH3NH2形成氢键,被氢键拽着没办法往Cu进一步靠近,所以收敛到了局部能量极小值点而不是全局能量极小值点。
好好用Molclus做一下构型搜索(http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=577),否则即使优化收敛了而且没有虚频,结果也是不能用的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-23 22:51:50 | 只看该作者 Only view this author
Kmetsch 发表于 2023-4-23 22:18
学会熟练使用Molclus进行构相搜索,你的gjf结构不甚合理

感谢感谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-23 22:52:16 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-23 22:42
不要随便摆个初始结构就优化。初学者的一个常见误区是认为,不管初始结构摆得多么不合理,只要结构优化收敛 ...

感谢!我好好学一下!

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