NVIDIA L20 GPU对gromacs的加速是否建议使用

jxin

NVIDIA L20 GPU，32vCPU， 256 GB内存
请教一下各位老师，在能够借用到这个配置的条件下，是否建议使用。因为看到多是v100和A100或是RTX3090这些相关的测评，所以对此想稍微确定一下。

student0618

why not just try it first

jxin

student0618 发表于 2025-5-19 12:35
why not just try it first

我想这个借用到如果对我的用处不大的话，徒增一些麻烦、烦恼，也会是一种资源的浪费。

xyan11

Gromacs基本还是用混合精度的多 fp32算力是主要指标

L20纯纸面的fp32性能是59.35 TFLOPS，公版4090纯纸面fp32性能是82.58 TFLOPS，公版5080是56.28 TFLOPS。

看你这配置像是云计算？如果纯省钱的角度 如果有游戏卡还是选游戏卡吧 毕竟云计算你也不用担心40/50系N卡烧接口的问题

希望有所帮助

k64_cc

L20没有FP64，惊不惊喜，意不意外？实测mixed precision下用L20，结果mean不变，但variance相比4090会暴增。计算自由能，variance 从9 +- 0.5 kcal/mol变成了9 +- 2.5 kcal/mol，构象分布可复现性差得离谱，吓得我还以为自己实现出问题了。