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[建模与可视化] 求助关于VMD显示原子电荷作图问题

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请问各位老师,我用VMD将原子电荷用原子着色方式显示之后(图1),我们导师希望能画一个里面还是正常的VMD显示各种原子(类似于图2),外面半透明的包着一层用原子着色显示的原子图(图1能半透明包在图2外面),不知道各位老师有没有什么办法?

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图1

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图2

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发表于 Post on 2023-4-20 18:21:24 | 只看该作者 Only view this author
graphics - representation设两个rep,用于着色的那个rep材质设成透明,原子球半径用得比显示结构的那个rep用的更大
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-21 08:33:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-20 18:21
graphics - representation设两个rep,用于着色的那个rep材质设成透明,原子球半径用得比显示结构的那个rep ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-21 09:23:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-20 18:21
graphics - representation设两个rep,用于着色的那个rep材质设成透明,原子球半径用得比显示结构的那个rep ...

老师还有个问题要请教您,如果我想画完图之后加一个刻度尺,那上下限的坐标单位是什么呢?(我的色彩刻度上下限用的是-0.01到0.01)

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发表于 Post on 2023-4-21 09:42:18 | 只看该作者 Only view this author
liang666 发表于 2023-4-21 09:23
老师还有个问题要请教您,如果我想画完图之后加一个刻度尺,那上下限的坐标单位是什么呢?(我的色彩刻度 ...

对于原子电荷是e
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-21 10:41:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-21 09:42
对于原子电荷是e

好的,谢谢老师

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