求助高斯输出文件到分子smile的转变方法

ccchxy · 发表于 Post on 2023-5-9 18:35:40

我想请问一下，有没有可能将高斯计算完的文件（.fchk、.log）中，提取结构并进行分析，然后获得其路易斯结构式（smile）。
我对一个含有负电子的小分子进行了计算，然后尝试进行键级分析，看起来像是多个共振式的叠加结果，不知道怎么能获得最大可能性的分子结构，gjf及log文件如下。

0.gjf (840 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1)

0.log (279.84 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

he_yixin · 发表于 Post on 2023-5-9 20:00:20

可以先用Multiwfn转化为通用的结构文件格式（如xyz），再用OpenBabel转化为SMILES

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[综合交流] 求助高斯输出文件到分子smile的转变方法