dmol3 TS Confirmation 如何分析

lina199904

大家好，我想请教一下TS confirmation计算结果应该如何分析
1.图1和1-2是同一个图，可以看到图中除反应物和产物外没有最低点，如果进行频率分析，发现只有一个虚频，那么是否可以说明TS search中的过渡态即为正确的过渡态，该反应是基元反应
2.图2中明显存在除反应物和产物以外的最低点，那么是否说明该反应不是基元反应，存在中间体，我是否应该提取出该中间体优化，然后在其与反应物和产物之间各自寻找过渡态
3.图3中也没有中间体，有一个虚频，那么是否可以说过渡态寻找成功
4.关于反应物为双分子，构建其共吸附构型时，应该将两个分子放在其各自最稳定的位点进行优化，还是先将吸附能大的分子放在其最稳定的位点上，然后另一分子在第一个分子周围位点进行摆放，看哪个共吸附构型能量最低就选哪个？
希望大家不吝赐教，谢谢！

安好

呜呜呜 请问你解决了吗
我认为的过渡态确认是在产物、反应物能量高于过渡态时才进行确认，可是我最近用Dmol3搜索了一氧化碳歧化反应的过渡态，只有一个虚频，我以为是正确的过渡态，可是我进行了TS confirmation，失败了，计算结果是下图，请问我这个过渡态是找错了吗？

lina199904

安好 发表于 2023-4-18 16:26
呜呜呜 请问你解决了吗
我认为的过渡态确认是在产物、反应物能量高于过渡态时才进行确认，可是我最近用Dmo ...

我也遇到过只有一个正确虚频，但过渡态确认失败的情况，经过微调反应物结构过渡态确认曲线就对了

寻常

请问你的前三个问题解决了么，我也有同样的疑问