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[新手求助] 请问PF6负离子用xtb计算能量报错是什么原因?

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我实验的体系是一个PF6负离子,采用molclus生成了100种构象,然后调用xtb进行能量计算,显示error:cannot find xtbopok file! ,在molclus文件夹下没找到xtb.out文件 ,去xtb文件夹下也没找到xtb.out文件 ,这个情况该怎么解决呢?我的molclus文件如下

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发表于 Post on 2025-12-14 23:13:50 | 只看该作者 Only view this author
stderr有输出吗
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2025-12-15 01:08:31 | 只看该作者 Only view this author
一个PF6负离子完全没必要做构型搜索,直接DFT优化就完了

Molclus运行中途直接杀掉任务,手动运行屏幕上的xtb命令看xtb.out的内容。被Molclus自动删了后自然就看不到了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-15 09:44:22 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Hanna110 于 2025-12-15 15:27 编辑
sobereva 发表于 2025-12-15 01:08
一个PF6负离子完全没必要做构型搜索,直接DFT优化就完了

Molclus运行中途直接杀掉任务,手动运行屏幕上 ...

多谢社长,已解决

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-15 15:21:15 | 只看该作者 Only view this author

没看见有

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-15 15:27:57 | 只看该作者 Only view this author
最后证明是PF6结构不合理的问题,用gview重新摆了一个就可以了

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