Gaussian 能量计算l202错误

Asanumber · 发表于 Post on 2017-5-3 18:44:29

最近帮师兄做一些分子的结构优化和能量计算。本来这些计算相对简单，不会出什么问题；但今天在计算分子能量的过程中，却遇到了如下错误：       本人使用的是Gaussian09 C01，系统为Ubuntu，所用基组为6-311G(d)，泛函为B3LYP。

      首先，将并五苯分子的电荷设置为-1，多重度设置为2，对其进行几何优化，得到结构A；

      然后，将A结构在GaussView上读取，保存gjf，并将gjf的电荷改为0，多重度改为1，即为附件的gjf；
      最后，问题出现了。用Gaussian对该gjf进行能量计算时，返回错误，log文件显示：logic error in ASyTop. Error termination via Lnkle in ***/l202.exe。
这种错误貌似比较罕见，没有发现靠谱的解决方案。所以，在这里求助各位，请问该计算错误的根源在哪里？有哪些可行的办法解决吗？谢谢了。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2017-5-3 19:37:42

本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-5-3 19:42 编辑

只要将分子坐标整体稍微旋转一个角度就可以解决这个问题，但具体原因还没搞清楚。

logic_error_in_ASyTop_Rotate.gjf (2.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 40)

(已排除版本（不含G16）、geom=connectivity、核数与内存的影响)

Asanumber · 发表于 Post on 2017-5-3 19:59:11

liyuanhe211 发表于 2017-5-3 19:37
只要将分子坐标整体稍微旋转一个角度就可以解决这个问题，但具体原因还没搞清楚。

这个难道是Gaussian的一个bug吗？问题很罕见，真是太寸了，被我赶上了。不过多谢大神帮忙啊，计算可以接着做了。

sobereva · 发表于 Post on 2017-5-4 11:02:44

这种高对称体系，高斯计算前一定要在gview里先对称化一下。从你的输入坐标里看，z值都带一些数值噪音，就算高斯不报错，算起来也比D2h对称性下慢得多得多。

Asanumber · 发表于 Post on 2017-5-4 13:44:50

sobereva 发表于 2017-5-4 11:02
这种高对称体系，高斯计算前一定要在gview里先对称化一下。从你的输入坐标里看，z值都带一些数值噪音，就算 ...

多谢指点。

leebo · 发表于 Post on 2017-10-7 03:22:44

liyuanhe211 发表于 2017-5-3 19:37
只要将分子坐标整体稍微旋转一个角度就可以解决这个问题，但具体原因还没搞清楚。

g16也出现了这个错误。

naonao5205 · 发表于 Post on 2020-6-25 15:31:38

在计算四氰基乙烯的时候出现了这个问题去掉symm=loose就不报错了（g16 a03）

lycheeho · 发表于 Post on 2023-5-29 08:41:40

liyuanhe211 发表于 2017-5-3 19:37
只要将分子坐标整体稍微旋转一个角度就可以解决这个问题，但具体原因还没搞清楚。

你好！请问如何实现分子坐标整体旋转一定角度的呢？

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2023-5-29 14:36:12

lycheeho 发表于 2023-5-29 08:41
你好！请问如何实现分子坐标整体旋转一定角度的呢？

GaussView按住Alt拖动

lycheeho · 发表于 Post on 2023-5-29 17:44:11

liyuanhe211 发表于 2023-5-29 14:36
GaussView按住Alt拖动

谢谢~

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Gaussian/gview] Gaussian 能量计算l202错误

评分 Rate

浏览过的版块