[GROMACS] 同一份代码在不同节点上执行差异极大

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发表于 Post on 2023-6-1 11:19:36 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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本帖最后由 zhengfa1024 于 2023-6-1 11:21 编辑

gromacs版本：gromacs-2020.6 gpu版本
GPU： nvidia v100
CPU ：Intel(R) Xeon(R) Gold 6226
调度系统： IBM LSF
显示使用方式为独占方式，GPU：CPU为1：3
提交命令：gmx_mpi mdrun -v -gpu_id 0 -pin on -update gpu -pme gpu -s a16heat.tpr

同样的任务提交到学校集群不同的节点上，这两个节点配置没有明显差异，但是资源利用率却相差极大，每个节点有8张显卡，我发现好像节点上没有其他任务资源利用率就比较高，有其他任务就很低，CPU的利用率也有明显差异

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