NBO分析报错l612

xiaobchine

这是我的输入文件：%nprocshared=16
%chk=int-s1l1-ty-NBO.chk
%mem=16GB
#p M06L/genecp pop=NBO6Read  scrf(smd,solvent=DiChloroEthane)
#geom=check guess=read

Title Card Required

0 1

C H O N F 0
6-311++G(d,p)
****
Pd 0
SDD
****

Pd 0
SDD

$NBO PLOT FILE=int-s1l1-ty-NBO $END




这是我的输出文件：
Electronic spatial extent (au):  <R**2>=          33515.7383
Charge=              0.0000 electrons
Dipole moment (field-independent basis, Debye):
    X=              4.2017    Y=             -4.3595    Z=              3.5699  Tot=              7.0288
Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=           -256.7121   YY=           -345.0076   ZZ=           -288.3922
   XY=            -27.3924   XZ=            -28.8191   YZ=              7.4289
Traceless Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=             39.9919   YY=            -48.3036   ZZ=              8.3117
   XY=            -27.3924   XZ=            -28.8191   YZ=              7.4289
Octapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**2):
  XXX=            234.7039  YYY=           -177.9827  ZZZ=             18.7850  XYY=            151.9291
  XXY=            108.2467  XXZ=             49.3737  XZZ=            -74.7831  YZZ=            -31.8008
  YYZ=            -21.1320  XYZ=            -13.1652
Hexadecapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**3):
XXXX=         -16851.1481 YYYY=         -16412.0821 ZZZZ=          -4221.9771 XXXY=            609.3781
XXXZ=           -480.9874 YYYX=           -296.3331 YYYZ=             44.4031 ZZZX=           -328.7288
ZZZY=            107.2293 XXYY=          -6647.5889 XXZZ=          -4380.0489 YYZZ=          -3337.4590
XXYZ=            170.7936 YYXZ=           -136.7029 ZZXY=           -226.0619
N-N= 8.025065886204D+03 E-N=-2.296602986040D+04  KE= 2.862762509823D+03
No NMR shielding tensors so no spin-rotation constants.
Leave Link  601 at Tue Aug 11 15:29:54 2020, MaxMem=  2147483648 cpu:        17.0
(Enter /share/apps/gauss/G09D01/g09/l612.exe)
Running external command "gaunbo6 R"
         input file       "/state/partition1/xiaob/int-s1l1-ty-NBO/Gau-70032.EIn"
         output file      "/state/partition1/xiaob/int-s1l1-ty-NBO/Gau-70032.EOu"
         message file     "/state/partition1/xiaob/int-s1l1-ty-NBO/Gau-70032.EMs"
         fchk file        "/state/partition1/xiaob/int-s1l1-ty-NBO/Gau-70032.EFC"
         mat. el file     "/state/partition1/xiaob/int-s1l1-ty-NBO/Gau-70032.EUF"

Writing Wrt12E file "/state/partition1/xiaob/int-s1l1-ty-NBO/Gau-70032.EUF"
Gaussian matrix elements                                         Version   1 NLab= 7 Len12L=8 Len4L=8
Write GAUSSIAN SCALARS               from file   501 offset           0 to matrix element file.
Write OVERLAP                        from file   514 offset           0 to matrix element file.
Write CORE HAMILTONIAN ALPHA         from file   515 offset           0 to matrix element file.
Write CORE HAMILTONIAN BETA          from file   515 offset      861328 to matrix element file.
Write KINETIC ENERGY                 from file   516 offset           0 to matrix element file.
Write ORTHOGONAL BASIS               from file   685 offset           0 to matrix element file.
Write DIPOLE INTEGRALS               from file   518 offset           0 to matrix element file.
Array DIP VEL INTEGRALS               on  file    572 does not exist.
Array R X DEL INTEGRALS               on  file    572 does not exist.
Write ALPHA ORBITAL ENERGIES         from file     0 offset           0 to matrix element file.
Write ALPHA MO COEFFICIENTS          from file 10524 offset           0 to matrix element file.
Write ALPHA DENSITY MATRIX           from file     0 offset           0 to matrix element file.
Write ALPHA SCF DENSITY MATRIX       from file 10528 offset           0 to matrix element file.
Write ALPHA FOCK MATRIX              from file 10536 offset           0 to matrix element file.
No 2e integrals to process.
Read Unf file /state/partition1/xiaob/int-s1l1-ty-NBO/Gau-70032.EUF:
Label Gaussian matrix elements                                         IVers= 1 NLab= 7 Version=ES64L-G09RevD.01
Title Title Card Required
NAtoms=    74 NBasis=  1312 NBsUse=  1302 ICharg=     0 Multip=     1 NE=   390 Len12L=8 Len4L=8
Label GAUSSIAN SCALARS                                                 NI= 1 NR= 1 NTot=       8 LenBuf=    2000 N=    1000       1       1       1       1
Label OVERLAP                                                          NI= 0 NR= 1 NTot=  861328 LenBuf=    4000 N=   -1312    1312       0       0       0
Label CORE HAMILTONIAN ALPHA                                           NI= 0 NR= 1 NTot=  861328 LenBuf=    4000 N=   -1312    1312       0       0       0
Label CORE HAMILTONIAN BETA                                            NI= 0 NR= 1 NTot=  861328 LenBuf=    4000 N=   -1312    1312       0       0       0

Label KINETIC ENERGY                                                   NI= 0 NR= 1 NTot=  861328 LenBuf=    4000 N=   -1312    1312       0       0       0
Label ORTHOGONAL BASIS                                                 NI= 0 NR= 1 NTot= 1708224 LenBuf=    4000 N=    1312    1302       0       0       0
Label DIPOLE INTEGRALS                                                 NI= 0 NR= 1 NTot= 2583984 LenBuf=    4000 N=   -1312    1312       3       0       0
Label ALPHA ORBITAL ENERGIES                                           NI= 0 NR= 1 NTot=    1302 LenBuf=    4000 N=    1302       0       0       0       0
Label ALPHA MO COEFFICIENTS                                            NI= 0 NR= 1 NTot= 1708224 LenBuf=    4000 N=    1312    1302       0       0       0
Store file  524 Len= 1708224.
Label ALPHA DENSITY MATRIX                                             NI= 0 NR= 1 NTot=  861328 LenBuf=    4000 N=   -1312    1312       0       0       0
Store file  528 Len=  861328.
Label ALPHA SCF DENSITY MATRIX                                         NI= 0 NR= 1 NTot=  861328 LenBuf=    4000 N=   -1312    1312       0       0       0
Label ALPHA FOCK MATRIX                                                NI= 0 NR= 1 NTot=  861328 LenBuf=    4000 N=   -1312    1312       0       0       0
Store file  536 Len=  861328.
External program failed.
Error termination via Lnk1e in /share/apps/gauss/G09D01/g09/l612.exe at Tue Aug 11 15:29:57 2020.
Job cpu time:       0 days  3 hours  8 minutes  8.4 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   1417 Int=      0 D2E=      0 Chk=    116 Scr=      1
(END)

十分感谢

sobereva

跑个简单体系，如果也有这个问题，应当是NBO配置不当，仔细看自带的安装说明。

xiaobchine

谢谢老师，麻烦您了

Scarlett-ww

xiaobchine 发表于 2020-8-13 08:07
谢谢老师，麻烦您了

你可以尝试修改一下路径。我安装时也遇到了这种报错，后来修改了路径，任务正常结束。
NBO直接解压到用户目录下（我的是NBO7）。
参照Sob老师的帖子，在~/.bashrc中加入export PATH=$PATH:~/NBO/nbo7/bin
在NBO/nbo7/bin/gaunbo6脚本中（因为我的G09 E.01版本，如果你的是G16 C.01后的，改gaunbo7）setenv BINDIR后为 ~/NBO/nbo7/bin

xiaobchine

Scarlett-ww 发表于 2020-10-8 20:48
你可以尝试修改一下路径。我安装时也遇到了这种报错，后来修改了路径，任务正常结束。
NBO直接解压到用 ...

谢谢老师

blankb

我遇到了类似的问题，最后发现gaunbo使用的tcsh，但是我的没有装，sudo apt-get install tcsh，就能解决问题了，当然路径之类的也要设置好