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[Gaussian/gview] 高斯出错提示g_write

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老师,我想问一下算大体系频率时出错 “ g_write” ,内存不够用,我在输入文件里怎么设置%rwf, 设置完怎么才能接着算呢?麻烦老师帮忙解答一下

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发表于 Post on 2017-12-16 01:48:17 | 只看该作者 Only view this author
这是硬盘不够,不是内存。
空出硬盘空间。将RWF写为有空间的硬盘分区上的完整文件路径(可以声明多个文件及其对应大小)。还不行就降低级别化简体系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-16 10:37:48 | 只看该作者 Only view this author
谢谢你,可以的话 能写个模板我参考一下吗

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发表于 Post on 2017-12-17 00:13:31 | 只看该作者 Only view this author

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-17 09:32:52 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师

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发表于 Post on 2023-2-14 17:23:33 | 只看该作者 Only view this author

社长您好,我在输入文件只指定了 %chk=xxx.chk,也出现了这种"Erroneous write. Write -1 instead of 4096.
fd = 4
orig len = 4096 left = 4096
g_write
"报错。我是使用SSH集群提交作业,那么将我自己子目录下的历史.chk文件删除可以解决问题吗?还是说是集群的硬盘空间不够了呢?谢谢

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发表于 Post on 2023-2-15 05:19:02 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-2-14 17:23
社长您好,我在输入文件只指定了 %chk=xxx.chk,也出现了这种"Erroneous write. Write -1 instead of 409 ...

跟chk文件没直接关系
搞清楚你当前运行Gaussian时Gaussian的临时文件目录是什么、那个目录下还有多少空余空间,不清楚的话问管理员并参考下文。默认情况下rwf文件是产生在那个目录下的,对于耗硬盘的任务,rwf文件远比chk占的硬盘大得多
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
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发表于 Post on 2023-2-15 10:36:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-15 05:19
跟chk文件没直接关系
搞清楚你当前运行Gaussian时Gaussian的临时文件目录是什么、那个目录下还有多少空 ...

社长,由于使用的是集群,所有子用户的临时文件都产生在那里,我已经联系了管理员清理;请问输入文件不设置.rwf文件是不是就不会在临时文件目录产生.rwf文件?

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发表于 Post on 2023-2-15 11:00:38 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wjc404 于 2023-2-15 11:04 编辑
糖糖糖豆9988 发表于 2023-2-15 10:36
社长,由于使用的是集群,所有子用户的临时文件都产生在那里,我已经联系了管理员清理;请问输入文件不设 ...

仔细看7楼社长给的链接文章。如果高斯的环境变量设置合理,当不指定rwf文件的路径时,默认会放到GAUSS_SCRDIR环境变量对应的路径下(shell下面"echo $GAUSS_SCRDIR"查看)。关于高斯程序的磁盘空间使用控制细节,可以看https://gaussian.com/maxdisk/

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发表于 Post on 2023-2-15 11:17:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 糖糖糖豆9988 于 2023-2-15 11:27 编辑
wjc404 发表于 2023-2-15 11:00
仔细看7楼社长给的链接文章。如果高斯的环境变量设置合理,当不指定rwf文件的路径时,默认会放到GAUSS_SC ...

您好,输入文件没有.rwf也会在临时目录里产生.rwf文件吗?管理员说清理了,但是报错“g_write”问题没有解决

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发表于 Post on 2023-2-15 14:16:59 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-2-15 11:17
您好,输入文件没有.rwf也会在临时目录里产生.rwf文件吗?管理员说清理了,但是报错“g_write”问题没有 ...

肯定的,要清临时文件,尤其是遗留的

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发表于 Post on 2023-2-16 06:42:01 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-2-15 11:17
您好,输入文件没有.rwf也会在临时目录里产生.rwf文件吗?管理员说清理了,但是报错“g_write”问题没有 ...

要么没清对地方,要么清完了剩余硬盘空间还是不够
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发表于 Post on 2023-2-16 10:45:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-16 06:42
要么没清对地方,要么清完了剩余硬盘空间还是不够

社长,我想要更改GAUSS_SCRDIR环境变量声明的临时文件夹,更改到自己的子目录下,方便及时清理以避免空间不足;但是在集群上还有作业正在运行的情况下,我是不是不能更改GAUSS_SCRDIR环境变量声明的临时文件夹呢?会影响正在计算的任务?

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发表于 Post on 2023-2-17 02:28:30 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2023-2-16 10:45
社长,我想要更改GAUSS_SCRDIR环境变量声明的临时文件夹,更改到自己的子目录下,方便及时清理以避免空间 ...

不影响正在计算的任务
你也可以直接用%rwf指定rwf生成在哪
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发表于 Post on 2023-2-17 09:57:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-17 02:28
不影响正在计算的任务
你也可以直接用%rwf指定rwf生成在哪

社长,由于我计算的是双自由基特征体系,如果第一步指定了.rwf文件的路径,那么两步任务的Link1里还需要像读取上一步.chk文件那样,读取上一步计算的.rwf文件吗?例如第一步写为%rwf=/home/lcc20/freq/ls/1-TS_H8SC1-1_stable.rwf,Link1里要写成%oldrwf=/home/lcc20/freq/ls/1-TS_H8SC1-1_stable.rwf吗?谢谢老师

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