求助packmol搭建模型后用DFTB跑动力学模拟一直报错

WLL! · 发表于 Post on 2024-10-9 15:16:23

packmol搭建碳氢原子的模型后用DFTB跑动力学模拟一直报如下错误，不断改变各种设置，调整原子之间的数目，距离，温度，盒子大小，仍然报错。请问各位老师，有什么办法解决吗？

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2024-10-9 19:20:44

别一上来就把问题推给packmol，除非是有别的软件构建初始结构运行成功的例子；研究目的和计算方法（包括软件及参数等）明明更加重要，请看社长博文http://sobereva.com/620补充清楚。
……
等等，这个碳原子和氢原子随机堆出来的结构，以及楼主希望通过计算获得的变化过程，真的具备化学意义吗？

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