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[综合交流] 双自由基体系如何正确使用热力学组合?

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楼主
Sob老师您好,我是第9届量化基础班的学员,我研究的是双自由基体系。在课上听您讲到计算双自由基体系应该使用对称破缺方式计算,关键词要加上guess=mix nosymm。后面您讲热力学组合的时候只要输入组合名就可以进行计算,这样可以用于双自由基体系吗?还是需要加上额外的关键词才可以?还有就是我的体系大概有不到30个原子,准备用CBS-QB3方法计算,对于双自由基体系来说,需要考虑非限制性开壳层计算(U)吗?

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发表于 Post on 2023-6-19 20:37:20 | 只看该作者 Only view this author
将近30个原子体系,CBS-QB3也可能算不动,特别是还是开壳层体系
CBS-QB3本身就没有考虑双自由基体系的计算,刻意用这个未必合适,甚至可能遭质疑。还不如老老实实用标准方式计算热力学量
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-20 09:45:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-19 20:37
将近30个原子体系,CBS-QB3也可能算不动,特别是还是开壳层体系
CBS-QB3本身就没有考虑双自由基体系的计算 ...

好的,老师。我准备用CCSD(T)/aug-cc-pvdz//pvtz外推CBS计算单点能,M062X/def2-tzvp进行几何优化和振动分析,您看这个级别的精度合适后面进行反应速率计算吗?

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发表于 Post on 2023-6-20 18:52:29 | 只看该作者 Only view this author
wangxing 发表于 2023-6-20 09:45
好的,老师。我准备用CCSD(T)/aug-cc-pvdz//pvtz外推CBS计算单点能,M062X/def2-tzvp进行几何优化和振动 ...

从你对体系的描述上看,并没有带弥散的必要,而且DZ->TZ外推太low。此外,开壳层的近30原子体系CCSD(T)/cc-pVTZ都算不动,更别提aug-cc-pVTZ了。就用UCCSD(T)/cc-pVTZ就完了,对于不重要的部分的原子可以减小为cc-pVDZ,通过混合基组可能能算得动。或者用NEVPT2也可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-20 21:05:00 | 只看该作者 Only view this author
sob老师不好意思,之前没有详细描述我研究的反应体系,我做的主要是气相反应,是CH2OO双自由基(包括2个C和3个C的)与甲酸乙酸等的双分子反应,过渡态结构最多不超过30个原子。因为反应物有很多氢,考虑可能有氢键的弱相互作用,所以加上弥散。请问老师有什么方法可以判断加弥散对该体系影响的大小?

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