计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 672|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[量化理论] 自相互作用误差

[复制链接 Copy URL]

40

帖子

0

威望

565

eV
积分
605

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 Lyy1 于 2023-6-29 12:24 编辑

1万

帖子

0

威望

7393

eV
积分
18146

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2023-6-21 19:39:59 | 只看该作者 Only view this author
建议用双杂化泛函。revTPSS是纯泛函,self-interaction error比B3LYP还严重。
一般测J coupling的精度的文章都是只测了闭壳层体系,对于开壳层体系很可能不适用。甚至于搞不好有的软件用的计算J coupling的公式在推导的时候就假设了体系是闭壳层,对于开壳层结果未必对,毕竟一般大家算两个核的J coupling都是为了算核磁,而如果附近有很大自旋密度,核磁峰本来就会展宽导致看不到耦合,所以有的程序未必会考虑到开壳层体系J coupling的计算需求。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2023-6-21 21:36:25 | 只看该作者 Only view this author
没有叫def-TV2P的基组
下文revTPSS/pcSseg-1适合使用仅是对于计算化学位移而言的,没涉及J,不要泛化到所有磁属性计算上
revTPSS泛函结合pcSseg-1基组是计算NMR很好的选择
http://sobereva.com/623http://bbs.keinsci.com/thread-25918-1-1.html

希望SIE小可以用比如wB97XD,或者MP2(Gaussian不支持MP2算J)。
算J需要用专门的基组,诸如pc-J,而用pcSseg这种通用基组绝对不行。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

40

帖子

0

威望

565

eV
积分
605

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-21 21:56:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Lyy1 于 2023-6-29 12:24 编辑

1万

帖子

0

威望

7393

eV
积分
18146

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2023-6-21 22:03:59 | 只看该作者 Only view this author
Lyy1 发表于 2023-6-21 14:56
谢谢老师,全氟棱烷结合一个额外电子形成的自由基阴离子应该是开壳层体系吧?用RB3LYP方法进行结构优化, ...


“用RB3LYP方法进行结构优化”不准确,你不可能用RB3LYP优化开壳层体系,如果你这么写但程序没报错,意味着程序自动给你改成了UB3LYP,你的优化仍然不能说是RB3LYP算的。
体系本身客观上是开壳层的,本来就不可能当作闭壳层算,所以不存在默认不默认的问题
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

40

帖子

0

威望

565

eV
积分
605

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-21 22:08:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Lyy1 于 2023-6-29 12:24 编辑

40

帖子

0

威望

565

eV
积分
605

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-21 22:11:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Lyy1 于 2023-6-29 12:23 编辑

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2023-6-22 00:39:24 | 只看该作者 Only view this author
Lyy1 发表于 2023-6-21 22:08
谢谢老师的回复,不好意思老师,基组我打错了,应该是def2-TZVP基组;导师的意思是通过阅读E. Johnson发 ...

仔细看文章理解所谓的校正是怎么做的,不可能什么细节都没说,简单的情况自己手算,实现复杂就找作者要程序。或者直接用SIE尽量小的理论方法就完了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

40

帖子

0

威望

565

eV
积分
605

Level 4 (黑子)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-22 15:11:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Lyy1 于 2023-6-29 12:24 编辑

1万

帖子

0

威望

7393

eV
积分
18146

Level 6 (一方通行)

10#
发表于 Post on 2023-6-22 16:43:51 | 只看该作者 Only view this author
Lyy1 发表于 2023-6-21 15:08
谢谢老师的回复,不好意思老师,基组我打错了,应该是def2-TZVP基组;导师的意思是通过阅读E. Johnson发 ...

注意解决self-interaction error问题一般不是通过在B3LYP结果基础上加某个校正实现的(虽然加校正的方法也是有的),而是通过重新换一个泛函来实现的。不是所有“误差”都是用校正的方式解决的,有的误差得靠推倒重来的方式解决
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

40

帖子

0

威望

565

eV
积分
605

Level 4 (黑子)

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-22 17:18:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Lyy1 于 2023-6-29 12:23 编辑

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 07:43 , Processed in 0.160891 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list