计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7359|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] bader电荷计算结果与电负性分析结果不一致,原因可能是什么?

[复制链接 Copy URL]

28

帖子

0

威望

179

eV
积分
207

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
根据元素的电负性,电负性越大得电子能力越强
比如用Ni和Mo ,Ni的电负性为1.91,Mo为2.16(鲍林标度),Ni-Mo成键时应该是电子向Mo转移
而bader电荷却显示Ni得电子Mo失电子
这两种分析不一致的原因是什么?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112460

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2021-11-29 17:49:38 | 只看该作者 Only view this author
AIM电荷很烂,看《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml),里面说了这种问题。甲基里氢的AIM电荷都能算成负的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

28

帖子

0

威望

179

eV
积分
207

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-30 09:29:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-29 17:49
AIM电荷很烂,看《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtm ...

谢谢sob老师,之前只是听说bader不好用,现在才知道这么烂。分析电子转移方向的时候您有什么建议吗?尝试别的电荷计算方法?
我后来又做了一下Ni-Mo的差分电荷,结果好像也是Mo是失电子的

1

帖子

0

威望

43

eV
积分
44

Level 2 能力者

4#
发表于 Post on 2021-11-30 15:06:31 | 只看该作者 Only view this author
加入参数 -b weight 看看:bader -b weight CHGCAR -ref CHGCAR_sum

28

帖子

0

威望

179

eV
积分
207

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-30 16:31:10 | 只看该作者 Only view this author
IMPLICIT-NONE 发表于 2021-11-30 15:06
加入参数 -b weight 看看:bader -b weight CHGCAR -ref CHGCAR_sum

谢谢,我试了一下,电子转移的情况没有改变
就是说直接是定性的分析  bader电荷就与电负性分析不一致

143

帖子

0

威望

1408

eV
积分
1551

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2021-11-30 22:00:16 | 只看该作者 Only view this author
我是大帅逼 发表于 2021-11-30 16:31
谢谢,我试了一下,电子转移的情况没有改变
就是说直接是定性的分析  bader电荷就与电负性分析不一致 ...

看电子转移不是应该看电荷差分吗
一蓑烟雨任平生

28

帖子

0

威望

179

eV
积分
207

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-1 16:19:47 | 只看该作者 Only view this author
ymeng 发表于 2021-11-30 22:00
看电子转移不是应该看电荷差分吗

我是做了的,差分电荷显示也是电子从Mo向Ni转移,还是与电负性分析不一致啊
之所以加bader是想更明确电子转移方向

143

帖子

0

威望

1408

eV
积分
1551

Level 5 (御坂)

8#
发表于 Post on 2021-12-1 16:50:15 | 只看该作者 Only view this author
我是大帅逼 发表于 2021-12-1 16:19
我是做了的,差分电荷显示也是电子从Mo向Ni转移,还是与电负性分析不一致啊
之所以加bader是想更明确电 ...

会不会potcar写反了。。。
一蓑烟雨任平生

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112460

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2021-12-2 05:43:40 | 只看该作者 Only view this author
我是大帅逼 发表于 2021-11-30 09:29
谢谢sob老师,之前只是听说bader不好用,现在才知道这么烂。分析电子转移方向的时候您有什么建议吗? ...

用别的原子电荷计算方法,诸如Hirshfeld-I、CM5等

“差分电荷”指代不明
如果是指密度差图要说清楚
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

27

帖子

0

威望

163

eV
积分
190

Level 3 能力者

10#
发表于 Post on 2023-6-30 09:31:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-12-2 05:43
用别的原子电荷计算方法,诸如Hirshfeld-I、CM5等

“差分电荷”指代不明

好的 感谢回答

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 11:41 , Processed in 0.224927 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list