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目前来看,我认为用虚拟机和在线平台统一管理诸多计算密集软件的方案短期内不会被科研人员广泛接受。主要原因有三点:
一,计算效率可能过低,价格过高。对于计算密集应用而言,使用虚拟机本身就会损失不少的计算速度,10%以上都很常见。另外平台提供的软件系统为了扩大适用面未必做了多少调优编译,做不做调优编译性能差20%到30%都很常见。为了节省机时费,有条件的大学都自建计算平台给校内课题组用,有的课题组甚至自购服务器。用商业超算本来就很贵,要是上云计算平台则更贵,甚至都不清楚看上去的一个CPU到底对应一个物理核还是一个逻辑核,性能还要大打折扣。其实较新的Ubuntu系统都可以直接sudo apt安装quantum espresso,cp2k和gromacs了,用的人也很少,一个原因就是计算速度和自行编译相比实在是太慢了。
二,软件功能受限。这个平台使用的很多包都是预编译好的,可能很老旧且功能不全面。从quantum mobile的首页提供的动图来看,提供的quantum espresso是6.2.1版,发布于6年前;cp2k是5.1版,发布于5年前。QE的最新版是7.2,cp2k的最新版是2023.2,这几年都经过了多个大更新,添加了很多功能,尤其是cp2k,这意味着原来做不了或者很费事的计算现在能算了,有新的课题可做。另外有的计算需要多种软件配合才能实现。
三,因为这个软件通过分发镜像发布,所以商业软件,如Gaussian,VASP等都是不能用的。这两个软件(特别是Gaussian)的功能和计算速度还是比开源软件快不少,在各自领域内大致有一半人主要用。当然有的平台类软件,比如ASE等支持使用Gaussian计算。
总之,目前而言类似这里的quantum mobile不会成为主流,可能只适合刚入门的人用。 |
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