计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 951|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[并行运算] 如何实现PBS任务优先分配到资源富足的节点

[复制链接 Copy URL]

73

帖子

0

威望

631

eV
积分
704

Level 4 (黑子)

各位大佬,小弟组里的小计算集群使用PBS进行任务管理分配,但据我观察,现分配方案是按顺序先把某一节点占满,再继续分配到下一节点,求问如何实现自动先分配到无任务的节点(资源更富足的节点),而不需要手动指定节点?

202308121716073494..png (36.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 68)

202308121716073494..png

202308121714566525..png (33.82 KB, 下载次数 Times of downloads: 65)

PBS示例

PBS示例

3806

帖子

4

威望

7994

eV
积分
11880

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2023-8-19 11:39:34 | 只看该作者 Only view this author
PBS的问题我不懂。我提醒一下哈,当前高斯环境变量定义不合理,合理示例(只需3行,不需要你那5行)
export g16root=/opt/soft
source $g16root/g16/bsd/g16.profile
export GAUSS_SCRDIR这行没变
自动做多参考态计算的程序MOKIT

73

帖子

0

威望

631

eV
积分
704

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-19 15:24:25 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-8-19 11:39
PBS的问题我不懂。我提醒一下哈,当前高斯环境变量定义不合理,合理示例(只需3行,不需要你那5行)
expor ...

多谢大佬指点,但是不太清楚二者区别是啥呢?您是说不简洁还是不正确,目前没发现当前定义方式在运行时出问题(或许是没发现?)

3806

帖子

4

威望

7994

eV
积分
11880

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

4#
发表于 Post on 2023-8-19 15:30:40 | 只看该作者 Only view this author
火车头 发表于 2023-8-19 15:24
多谢大佬指点,但是不太清楚二者区别是啥呢?您是说不简洁还是不正确,目前没发现当前定义方式在运行时出 ...

谈不上不正确。只是不合理+不简洁,以后不知道啥时候踩坑,到时候找半天问题。GAUSS_EXEDIR在g16.profile中是有定义的,但你偏偏不用,要自己定义。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

73

帖子

0

威望

631

eV
积分
704

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-19 16:50:59 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-8-19 15:30
谈不上不正确。只是不合理+不简洁,以后不知道啥时候踩坑,到时候找半天问题。GAUSS_EXEDIR在g16.profile ...

谢谢大佬,我去改一下

195

帖子

0

威望

4029

eV
积分
4224

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2023-8-19 19:03:48 | 只看该作者 Only view this author
查了下在maui里面修改NODEALLOCATIONPOLICY 为CPULOAD模式。
参考PBS调度系统管理和使用
maui 限制使用节点数

73

帖子

0

威望

631

eV
积分
704

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-19 20:22:50 | 只看该作者 Only view this author
tiandikuoyuan 发表于 2023-8-19 19:03
查了下在maui里面修改NODEALLOCATIONPOLICY 为CPULOAD模式。
参考PBS调度系统管理和使用
maui 限制使用节 ...

好的,感谢,我研究一下

2301

帖子

1

威望

5473

eV
积分
7794

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2023-8-21 20:06:01 | 只看该作者 Only view this author
与调度策略有关系……
默认的,是把计算任务放在一台机器上……
因为发型的计算平台,会根据负载,自动关闭没有负载的机器,以节省能源消耗……

修改调度策略,需要查阅楼上提到的手册……

另外,g16,64核心,效率也不差呢……
没有单个任务核心数目限定的话,直接用多核心计算……
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 19:12 , Processed in 0.177717 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list