1.写在前面： 主要是做缺陷材料/新化合物研究的，主要计算能带/态密度/缺陷形成能等，因为需要进行100-1000原子的结构优化和DFT计算，按照sobereva的推荐，自己组了一台AMD单路的电脑。在量子化学群和网络教程上的问题解决了很多问题，有些问题很费时间，所以踩过的坑，大家就看贴跨过去吧！
2.机器配置：
cpu AMD R9 5950x
主板 微星b550m迫击炮
内存 金百达3600 32g*4
固态 金士顿 500g
显卡 任意
机箱 爱国者yogom4pro
电源 微星迫击炮650w
散热 利民360（感谢@瓜皮群主推荐配置，20221111）
3.安装系统： 1）踩坑1 (AMD5950不支持Centos7.X，我下的7.6) 方案：下载系统（直接镜像或者官网下载）+ultraSO制作USB启动盘（UEFI+硬盘GPT格式）安装，微星主板，调整启动项，U盘启动就行 CentOS7 No!!!!!!系统硬件是不识别的，直接放弃 CentOS8 stream YES!!!!!!!硬件识别，但无法安装 问题1：【centOS8安装报started cancel waiting for multipath siblings of sda问题】 解决方案：https://blog.csdn.net/m290345792/article/details/119385505 问题解析：系统找不到U盘的位置，改到他认识的位置就好 2） 踩坑2 （双系统无法打开Centos，开机就进win10） 问题2：安装到最后一步，reboot，完事之后重启直接进入win10，调整启动盘的顺序也无济于事 解决方案：微星开机按F11，选择CentOS8 stream （感谢瓜皮群主的群友@野百合也有春天） 问题解析：UEFI的启动顺序问题 到这一步，已经完成安装，进入系统的设置，见大佬sobereva的b站视频，设置同视频
4.编译VASP 方案：Intel 的编译器最新版安装+VASP编译 踩坑3 ：Intel 的2019和2020版的编译器 不知为何 许可证明都过期了 无法使用
varpro.F(493): catastrophic error: Function return parameter requires SSE register while SSE is disabled. compilation aborted for varpro.f90 (code 1)
make[2]: *** [makefile:169：varpro.o] 错误 1
make[2]: 离开目录“/sanqiu/vasp.5.4.4/build/std”
cp: 无法获取'vasp' 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录解决方案：Makefile.include 中的-xhost 对于AMD的编译 改为 --mAVX，代表用ifort编译出可以用于所有支持AVX指令集的CPU（不限于Intel的）的可执行文件。至少对于ifort 19，-m最高只能支持到AVX。 之后就完美安装了 但随后出现关于GPU的报错 不必理会 按照大神的方法 跑一遍Hg的测试程序 没问题就好
5.编译Materials Studio + Centos 8 Stream 踩坑6 ：安装很简单，但Centos 的新系统会有缺很多组件，导致安装失败 失败代码： 解决方案：增加系统的命令补丁，参考https://blog.csdn.net/weixin_40069439/article/details/127482541 以上的问题 链接中没有提到，自己摸索得到答案（解决了还是蛮开心的，哈哈哈哈哈哈），运行以下代码可以解决： sudo yum install tcsh
踩坑6： Windows 端链接Centos服务器，第一次可以，重启Centos后第二次就失败了，报错代码 Error in http test: Unexpected server gateway error. Code 408 Description: time out Tests failed 代码的上半段讲的是连接到服务器主机了，Ping 是通的，所以是链接主机的状态，但连不上端口 解决方案：1.检查http://主机ip:18888/在Centos 的浏览器上能不能打开，打不开说明是MS lunix gateway 的服务没打开 运用以下代码，重启服务，再试试链接，如果还有问题，看2 2. 如果是http://主机ip:18888/在Centos 的浏览器上能打开，但windows gateway 报错（先refresh gateway 本地的端口，如果通过了进行下一步；如果通不过，重启以下windows里的gateway 服务，再试链接)，说明lunix 的防火墙把软件端口墙了，运行以下代码，关闭防火墙，就success了 （感谢理论计算公社的 @蒙特脱氢脱不掉卡洛 ） systemctl stop firewalld #开启防火墙 systemctl disable firewalld #禁用防火墙 （不建议）
新人入计算 好难呀 大量的小问题 也许就让我们萌生了退缩的念想 所以感谢前辈的无私分享和排忧解难！ 这也是写这个贴子的初衷，大家可以帖子下面贴问题，我可能上的不太勤 看到了我会回复的！
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发表于 Post on 2023-3-9 11:29:47
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