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[波函数分析求助] 求助:multiwfn分析2d指纹图时,是否能得到h-h h-o h-n这种细致的百分比

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本帖最后由 WuQs 于 2023-10-27 19:28 编辑

1.最近在学习制作hirshfeld和2d指纹图,发现multiwfn和crystal explore都可以做,因为我根本就不会后者,所以想用前者做,但是我看到别人的图是这样的,
细致到各种类型的键都有,我想咨询multiwfn是否可以这样,如果可以是在哪一步操作哪种类型的键
2.在选择元素的那个选项,我看例子是CL,如果我在此写H,是代表H-H还是所有类型的氢键。



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发表于 Post on 2023-10-27 08:35:36 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn被拼错了两次

在选择元素的那个选秀  语义不明。Multiwfn手册的例子用的是尿素,没牵扯Cl

每种情况分别定义里、外部分的元素,就能得到相应的接触面积

Multiwfn手册里的例子演示了:
Next, we check the fingerprint plot between the hydrogens in the central urea and the oxygen atom marked by the yellow arrow in above figure. Input the following commands
-1 // Return to upper level of menu
1 // Set the inside atoms to consider
[Press ENTER button] // Do not set constraint for atomic indices
H // The inside atoms must be hydrogen
2 // Set the outside atoms to consider
76 // The index of the oxygen in one of surrounding urea
[Press ENTER button] // Do not set element filter condition
0 // Start fingerprint analysis


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-27 19:20:58 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 WuQs 于 2023-10-27 19:32 编辑
sobereva 发表于 2023-10-27 08:35
Multiwfn被拼错了两次

在选择元素的那个选秀  语义不明。Multiwfn手册的例子用的是尿素,没牵扯Cl

不好意思老师,我以后发完贴会再检查一下,纯粹粗粗心没有恶意;我想分析N-H的,N是内部,H是外部。我尝试了您上述的步骤,但是当我的命令是
-1//return to upper level of menu
1//
enter
N//主体分子上的N
2
enter//必须输入H的index吗
H//外面的分子
0//这一步之后闪退

还有个想问的问题,就是如果我在设置内部元素的时候选了H,没有设置外部元素,得到的数据是所有的氢键,还是有默认的元素,比如H-H

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-27 19:26:47 | 只看该作者 Only view this author
WuQs 发表于 2023-10-27 19:20
不好意思老师,我以后发完贴会再检查一下,纯粹粗粗心没有恶意;我想分析N-H的,N是内部,H是外部。我尝 ...

又尝试了几次可以了,感谢老师的指导

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