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[波函数分析求助] 求助:用Multiwfn和VMD绘制hirshfeld外层分子缺失

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最近在分析共晶的hirshfeld时,发现确定完中心的主体分子之后,外层的配体分子缺失,导致表面不闭合。
操作是按照卢天老师在B站的视频和multiwfn英文手册的4.12.6做的,做了好几遍都是一样的,在倒数第二步的时候选-3查看的时候还是正常的。
补充:1.外层剩余的分子是和我选择的中心分子是一样的,结晶水还保留在外层,但是配体分子全不见了
          2.这个晶体分子就是由两种分子和结晶水组成的
          3.想要显示全部抠出的团簇
求求大佬帮助,确实对这个表面分析不太在行。

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实际得到的结果

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想分析的团簇

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发表于 Post on 2023-10-26 07:55:41 | 只看该作者 Only view this author
把簇抠大点不就完了
"倒数第二步" 指代不明

不要24小时内在思想家公社QQ群和计算化学公社论坛里问同一问题,注意看群文件里群规,以及论坛置顶的论坛新社员必读贴
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-26 09:17:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-26 07:55
把簇抠大点不就完了
"倒数第二步" 指代不明

好的,谢谢老师,我下次注意,因为我怕您看不到,所以同时在两个地方提问;

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