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[Amber] 请问Amber模拟过程中,怎么查看硬件瓶颈?从而调优最大化发挥性能?

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Level 2 能力者

各位老师好!我是新入手训练的小白,电脑配置:CPU: AMD 7950X, 内存: 64GB, 显卡: RTX4080super; 软件配置:CUDA12.4, Amber24和AmberTools24,我运行一个配体和蛋白质的200ns模拟体系,共27425个原子,运行期间我分别用top和nvidia-smi命令查看,cpu占用率100%, 显卡使用率86%,具体如下图。请问老师们,这是cpu是瓶颈了嘛?附件为坐标文件。

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nvidia-smi

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