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[综合交流] 求助,关于rdkit里BRICS模块下的build函数

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楼主
我先使用decompose函数把一个ABCD分子分解成A,B,C,D的片段,然后我想用build把这几个片段组装回去(ABCD或者ACBD无所谓,只要保证一个每个片段都出现且只出现一次即可)
但用build处理过后的所有结果里存在诸如ABA,DCCD这种分子,但就是没有我想要的ABCD,请问要如何才能实现我想要的效果?
顺便吐槽一下官方文档里关于BRICS模块的部分https://www.rdkit.org/docs/source/rdkit.Chem.BRICS.html,其他几个函数都讲得挺详细,就这个build函数是一笔带过。。。

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发表于 Post on 2023-8-4 15:03:13 | 只看该作者 Only view this author
请问问题解决了吗?我也遇到同样的问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-20 14:35:08 | 只看该作者 Only view this author
Timeless 发表于 2023-8-4 15:03
请问问题解决了吗?我也遇到同样的问题。

抱歉很久没上这个论坛了,今天才看到你的回帖
后来我也没在rdkit里找到能解决这个问题的方法,所以自己写了一个,因为项目过去太久了我自己看那堆屎山也有点费劲,所以我把这部分单独拎出来,希望对你有帮助

frag_build.py

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