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[综合交流] 求助分子或自由基BDE计算

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本帖最后由 shaserena 于 2020-11-9 19:04 编辑

求助,本人论文中计算了若干反应路径。收到审稿意见如下,

When working with different C-centred radicals itwould be beneficial to reader to see relative stabilisation energies (RSE)and/or bond dissociation energies (BDE) for each calculated species. Thus, by comparing BDEs of different chemical species(CS) one could easily predict thermodynamics of the reaction. Please add a RSE/BDE scheme with all the CS present.

想请问分子或者自由基的键解离能是什么?应该怎么计算。

我看对一个化学反应来说键解离能是焓的差,比如A-B → A• + B•,BDE=H(A•)+H(B•)-H(A-B)。那对于其中的A-B,A•以及B•,这三种分子或自由基,他们的BDE又怎么计算呢?

这是我计算的两个反应

想求助如何应对审稿人问题。


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发表于 Post on 2020-11-9 14:59:38 | 只看该作者 Only view this author
不存在分子或者自由基的BDE的说法,BDE是对于键而言的,而不是对于分子而言的。比如甲醇里的C-H键、C-O键、O-H键的BDE都是不同的,所以不存在甲醇的BDE这个说法。
至于具体需要算哪些键的解离能才能对于你的问题起到说明作用,那取决于你研究的具体是什么化学过程。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-9 17:20:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-9 14:59
不存在分子或者自由基的BDE的说法,BDE是对于键而言的,而不是对于分子而言的。比如甲醇里的C-H键、C-O键、 ...

多谢回复,您看是不是这个意思甲醇里的C-H键的BDE
BDE(H-CH2OH)=H(H)+H(CH2OH)-H(CH3OH)
甲醇里的C-O键的BDE
BDE(CH
3-OH)=H(OH)+H(CH3)-H(CH3OH)

这样算对吗?(上面式子里自由基都没加点,网页编辑不会加

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-9 19:03:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-9 14:59
不存在分子或者自由基的BDE的说法,BDE是对于键而言的,而不是对于分子而言的。比如甲醇里的C-H键、C-O键、 ...

我重新编辑了问题,可否帮忙看一下,按照审稿人的要求我应该怎么做,或者给解释一下审稿人到底什么意思

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发表于 Post on 2020-11-10 02:04:05 | 只看该作者 Only view this author
shaserena 发表于 2020-11-9 17:20
多谢回复,您看是不是这个意思甲醇里的C-H键的BDE
BDE(H-CH2OH)=H(H)+H(CH2OH)-H(CH3OH)
...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-11-10 08:25:28 | 只看该作者 Only view this author
shaserena 发表于 2020-11-9 19:03
我重新编辑了问题,可否帮忙看一下,按照审稿人的要求我应该怎么做,或者给解释一下审稿人到底什么意思

你的CS2到CS3的反应条件是什么?
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-10 10:04:16 | 只看该作者 Only view this author

多谢sob老师,想继续请教G3方法算出来的单点能,活化能是否比b3lyp/6-311++g(d,p)构型优化得出的BDE精度高一些?有没有相关的文献之类的

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发表于 Post on 2020-11-10 11:04:29 | 只看该作者 Only view this author
shaserena 发表于 2020-11-10 10:04
多谢sob老师,想继续请教G3方法算出来的单点能,活化能是否比b3lyp/6-311++g(d,p)构型优化得出的BDE精度 ...

能高不少,但是计算量大。文献就看G3方法的原始文献就行
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发表于 Post on 2020-11-11 00:36:18 | 只看该作者 Only view this author
shaserena 发表于 2020-11-10 10:04
多谢sob老师,想继续请教G3方法算出来的单点能,活化能是否比b3lyp/6-311++g(d,p)构型优化得出的BDE精度 ...

G3完全过时了,如今毫无实用价值
仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-1132-1-1.html
BDE不是高一些,而是有天壤之别

热力学组合方法算的是热力学量,不是算单点能的
另外,活化能是通过阿伦尼乌斯公式拟合的,不是量化直接算出来的,仔细看
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html
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发表于 Post on 2023-11-16 22:23:58 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-9 14:59
不存在分子或者自由基的BDE的说法,BDE是对于键而言的,而不是对于分子而言的。比如甲醇里的C-H键、C-O键、 ...

老师,请问对于环状分子开环反应,想要判断哪个键容易断是算BDE吧?可是只断一个键长产物也只有一个,那BDE公式是H开环后的分子减去H环状分子吗?

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发表于 Post on 2023-11-17 21:30:07 | 只看该作者 Only view this author
嘤嘤嘤 发表于 2023-11-16 15:23
老师,请问对于环状分子开环反应,想要判断哪个键容易断是算BDE吧?可是只断一个键长产物也只有一个,那B ...

http://sobereva.com/522的方法算,虽然说的是氢键,但是不难推广到共价键
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发表于 Post on 2023-11-18 11:51:52 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-11-17 21:30
按http://sobereva.com/522的方法算,虽然说的是氢键,但是不难推广到共价键

好的,谢谢老师

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