计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 471|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[辅助/分析程序] OfakeG转换orca的频率文件不成功,怎样根据orca输出文件自己算

[复制链接 Copy URL]

191

帖子

0

威望

493

eV
积分
684

Level 4 (黑子)

以下是orca的频率计算的输出文件关于能量的内容:

Summary of contributions to the inner energy U:
Electronic energy                ...  -9478.27185452 Eh
Zero point energy                ...      2.48727026 Eh    1560.78 kcal/mol
Thermal vibrational correction   ...      0.15565148 Eh      97.67 kcal/mol
Thermal rotational correction    ...      0.00141627 Eh       0.89 kcal/mol
Thermal translational correction ...      0.00141627 Eh       0.89 kcal/mol
-----------------------------------------------------------------------
Total thermal energy                  -9475.62610024 Eh


Summary of corrections to the electronic energy:
(perhaps to be used in another calculation)
Total thermal correction                  0.15848403 Eh      99.45 kcal/mol
Non-thermal (ZPE) correction              2.48727026 Eh    1560.78 kcal/mol
-----------------------------------------------------------------------
Total correction                          2.64575428 Eh    1660.23 kcal/mol


--------
ENTHALPY
--------

The enthalpy is H = U + kB*T
                kB is Boltzmann's constant
Total free energy                 ...  -9475.62610024 Eh
Thermal Enthalpy correction       ...      0.00094421 Eh       0.59 kcal/mol
-----------------------------------------------------------------------
Total Enthalpy                    ...  -9475.62515603 Eh

GIBBS FREE ENERGY
-------------------

The Gibbs free energy is G = H - T*S

Total enthalpy                    ...  -9475.62515603 Eh
Total entropy correction          ...     -0.31862358 Eh   -199.94 kcal/mol
-----------------------------------------------------------------------
Final Gibbs free energy         ...  -9475.94377961 Eh

For completeness - the Gibbs free energy minus the electronic energy
G-E(el)                           ...      2.32807491 Eh   1460.89 kcal/mol

1)请问Eh直接对应Hartree对吗?
2)Electronic energy是不是直接对应gaussian的electronic energy?
3) Total thermal correction是不是直接对应gaussian的Thermal Correction to Energy?
4)Zero point energy 是不是对应gaussian的Zero-point Energy Correction?
5)Thermal Enthalpy correction是不是对应Thermal Correction to Enthalpy?
6)G-E(el) 是不是对应Thermal Correction to Free Energy?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-3-5 02:55:22 | 只看该作者 Only view this author
算热力学量根本就不牵扯OfakeG,明明OfakeG的初衷是让用户能通过GaussView看ORCA的输出文件,下文明确说了
OfakeG:使GaussView能够可视化ORCA输出文件的工具
http://sobereva.com/498http://bbs.keinsci.com/thread-13952-1-1.html

Shermo直接支持ORCA振动分析输出文件计算各种热力学量,使用非常方便、输出信息清晰易懂,仔细看
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

191

帖子

0

威望

493

eV
积分
684

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-5 10:31:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-5 02:55
算热力学量根本就不牵扯OfakeG,明明OfakeG的初衷是让用户能通过GaussView看ORCA的输出文件,下文明确说了
...

请问我如果已经在计算频率的时候加了QRRHO,又不想重新算一遍没有加QRRHO的频率,这时候该怎么办?可以直接分析orca的输出文件吗?还是说可以用带了QRRHO的频率输出文件导入Shermo再算一遍?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2024-3-5 11:47:21 | 只看该作者 Only view this author
Oliviaw 发表于 2024-3-5 10:31
请问我如果已经在计算频率的时候加了QRRHO,又不想重新算一遍没有加QRRHO的频率,这时候该怎么办?可以直 ...

搞清楚什么是QRRHO,那是算完了频率之后算热力学数据的事,不是算频率时候的事。仔细把Shermo手册附录看了,搞清楚热力学量是怎么计算的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 10:04 , Processed in 0.485028 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list