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[其它程序] 求助lobster计算COHP,对于周期性体系边界原子的识别

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Lobster计算CeO2表面Ce和O之间的ICOHP值,导出的CONTCAR中Ce42和O138相连,但是ICOHPLIST.lobster文件中确显示这个两个原子距离较远,请问各位老师出现这个现象的原因和解决方法是什么?

Fig1.png (231.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 58)

Fig1.png

Fig2.png (486.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 58)

Fig2.png

CONTCAR

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ICOHPLIST (2).lobster

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发表于 Post on 2025-7-9 10:20:40 | 只看该作者 Only view this author
同问!请问博主解决了吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-9 20:09:38 | 只看该作者 Only view this author
Up1996 发表于 2025-7-9 10:20
同问!请问博主解决了吗

没有haha,如果你解决了的话捞捞我

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发表于 Post on 2025-7-16 09:26:11 | 只看该作者 Only view this author
xilemiki 发表于 2025-7-9 20:09
没有haha,如果你解决了的话捞捞我

我的解决方法就是换个一样的原子,其他原子对可以用

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发表于 Post on 2025-7-16 11:06:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 orangesea 于 2025-7-16 11:08 编辑

这个软件的默认设置好像不能考虑周期性,在盒子两侧的原子是按盒子内的距离算的,你这两个原子可能刚好判断位于盒子两侧,有没有大佬解答一下如何考虑周期性

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