有机自由基分子在气相和界面相的SOMO轨道对比分析

秋心

各位老师好，我最近在研究一个有机自由基在气相和气液界面的两条分解路径（结构见图一），一条路径生成CO，另一条生成OCS，通过分子动力学模拟发现该自由基在气相和界面的分解产物截然相反，气相主要是CO，界面主要是OCS，之前浏览公社帖子的时候了解到一个自由基的分解能垒并不是单纯看分解时对应的那个键的强度（键能）还与轨道的重组有关，因此我想从分子轨道的角度尝试去解释我得到界面主要分解路径为OCS的结果。我分别使用CP2K产生气相和界面的molden文件，采用的方法是BLYP，基组是DZVP-MOLOPT-SR，然后使用multiwfn分析气相和界面的SOMO轨道，得到图一和图二的结果，发现轨道确实有变化。我的问题是我不能确定我这样对比分析是否合理是否正确。如果分析合理正确的话，又该怎么结合轨道变化的结果去解释界面自由基分解的结果呢？

sobereva

光靠看SOMO很难说明什么
动力学得反复多跑几次，用统计结果说事，避免偶然性的巧合
而且得从结构和原理上思考液体表面对反应起到了什么作用，诸如是影响了自由基分子的主要构象、液体分子和自由基分子产生了什么相互作用，亦或是什么其它的

秋心

sobereva 发表于 2023-12-3 03:00
光靠看SOMO很难说明什么
动力学得反复多跑几次，用统计结果说事，避免偶然性的巧合
而且得从结构和原理上 ...

谢谢sob老师。对于自由基在液体表面的分解分子动力学模拟我做了十二条（这十二条自由基分子的初始位置均不一样），十二条轨迹得到的结果均是生成OCS。我明白老师您的意思了，我用比较界面和气相的SOMO轨道的方法去解释界面为什么只生成OCS像是在用现象解释现象，并不是从最根本上去解释，应该从结构和原理这种最基础的方面去解释，比如表面水的部分溶剂化作用，液体表面的电场等等。