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[新手求助] 过渡态使用直角坐标出错

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刚开始做量化计算的时候,找过渡态使用的内坐标,一直也没在意,有一次保存成直角坐标,刚提交任务就出错,请问老师,用直角坐标找过渡态是不是要添加什么关键词啊,烦请格外老师不吝赐教,谢谢!

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发表于 Post on 2016-9-28 11:58:07 | 只看该作者 Only view this author
这个和你的初始坐标输入没有关系,guassian 优化默认就用的内坐标,倒是你想用直角坐标优化得输入opt=cartesian。你最好检查一下报错信息再考虑到底是啥问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-28 12:21:43 | 只看该作者 Only view this author
librakitty 发表于 2016-9-28 11:58
这个和你的初始坐标输入没有关系,guassian 优化默认就用的内坐标,倒是你想用直角坐标优化得输入opt=carte ...

好的。谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-28 12:31:58 | 只看该作者 Only view this author
librakitty 发表于 2016-9-28 11:58
这个和你的初始坐标输入没有关系,guassian 优化默认就用的内坐标,倒是你想用直角坐标优化得输入opt=carte ...

我关键词是opt=(calcfc,ts,ef,maxcycle=400,cartesian),用的直角坐标,然后直接报错,Error: segmentation violation

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发表于 Post on 2016-9-28 12:45:42 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2016-9-28 12:31
我关键词是opt=(calcfc,ts,ef,maxcycle=400,cartesian),用的直角坐标,然后直接报错,Error: segmentati ...

压缩后上传输出,segmentation violation毛线信息都没有。
还用eigenvalue following,要么是根本不明白它什么意思,要么是用了啥毫无意义的水平来优化。
maxcycle垃圾关键词
不用cartesian不出错就别用

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-28 17:06:25 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-9-28 12:45
压缩后上传输出,segmentation violation毛线信息都没有。
还用eigenvalue following,要么是根本不明白 ...

谢谢老师,附件如下,麻烦您查看解答 OSNNCOconformer1to3.log (5.43 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-28 17:52:17 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-9-28 12:45
压缩后上传输出,segmentation violation毛线信息都没有。
还用eigenvalue following,要么是根本不明白 ...

高斯说明书上说。对于所有不能使用解析梯度的计算方法,几何优化计算的默认算法是本征值跟踪算(Opt=EF),EF是什么意思我确实不理解,不知道老师能否解答一下

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发表于 Post on 2016-9-28 19:08:02 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2016-9-28 17:52
高斯说明书上说。对于所有不能使用解析梯度的计算方法,几何优化计算的默认算法是本征值跟踪算(Opt=EF), ...

和默认的优化方法大同小异
没必要手动去指定之
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-9-28 20:56:19 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2016-9-28 17:06
谢谢老师,附件如下,麻烦您查看解答


你这就是本来用不着EF非要用,然后瞎用EF还不会用。不要写任何自己不理解的关键词







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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-29 09:33:06 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-9-28 20:56
你这就是本来用不着EF非要用,然后瞎用EF还不会用。不要写任何自己不理解的关键词

谢谢老师,我把ef去掉就可以运算了,还有请教一下,说明书中对MaxCycle=N的解释是:指定优化计算最大迭代次数为N。默认是(默认的计算程序)所用冗余内坐标数目的两倍,最大为20,或是(其它计算程序)做优化计算的变量数目的两倍。它说最大值是20,为什么我写400不会出错?

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发表于 Post on 2016-9-29 09:37:12 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2016-9-29 09:33
谢谢老师,我把ef去掉就可以运算了,还有请教一下,说明书中对MaxCycle=N的解释是:指定优化计算最大迭代 ...

最大迭代次数一般对于优化没什么帮助的,具体可以看http://sobereva.com/164

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发表于 Post on 2016-9-29 11:52:15 | 只看该作者 Only view this author
做过渡态要学学此文:  http://sobereva.com/44

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-29 12:44:28 | 只看该作者 Only view this author
KiritsuguPapa 发表于 2016-9-29 11:52
做过渡态要学学此文:  http://sobereva.com/44

谢谢,请问过渡态出现 Error termination request processed by link 9999重新保存之后依然是这个问题,是不是跟基态处理方法不同

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发表于 Post on 2016-9-30 11:01:51 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2016-9-29 12:44
谢谢,请问过渡态出现 Error termination request processed by link 9999重新保存之后依然是这个问题, ...

仔细看11楼发的那个地址的文章,优化不收敛的解决办法。肯定不是直接保存最后结构重跑就行的,这样和用maxcyc没有区别。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-30 11:23:20 | 只看该作者 Only view this author
KiritsuguPapa 发表于 2016-9-30 11:01
仔细看11楼发的那个地址的文章,优化不收敛的解决办法。肯定不是直接保存最后结构重跑就行的,这样和用ma ...

优化不收敛显示的不应该是l502么。如果跟maxcyc没有区别,那为什么在基态出现这种情况的时候这么处理一般都是可行的,如果您知道的话,是否可以详细解答一下,谢谢!

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