软件求助：多元环上色

dummy1 · 发表于 Post on 2023-12-5 17:57:59

请问大家类似附件这样的图，比如石墨烯中，五元环用红色，七元环用蓝色，六元环不上色，用什么软件可以实现？谢谢

lindlar · 发表于 Post on 2023-12-5 19:34:56

本帖最后由 lindlar 于 2023-12-5 19:36 编辑

chemdraw就可以干这事吧。https://www.bilibili.com/video/B ... d116f7fb2504eac660e；https://www.bilibili.com/video/B ... d116f7fb2504eac660e

pal · 发表于 Post on 2023-12-5 19:43:17

我猜这个说的是自动识别然后上色吧，手动的话画图板都可以

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-6 02:14:47

VMD里可以用paperchain风格填充多元环，用比如maxringsize 5 from all选择所有在5元环上的原子，着色可以选ColorID自己指定

dummy1 · 发表于 Post on 2023-12-6 14:23:48

pal 发表于 2023-12-5 19:43
我猜这个说的是自动识别然后上色吧，手动的话画图板都可以

是的，自动识别上色。不过我是有石墨烯的xyz结构，然后想用软件画出附件这种结构图再上色。

dummy1 · 发表于 Post on 2023-12-6 14:24:25

lindlar 发表于 2023-12-5 19:34
chemdraw就可以干这事吧。https://www.bilibili.com/video/B ... d116f7fb2504eac660e；https://www.bilibi ...

感谢！

dummy1 · 发表于 Post on 2023-12-6 14:31:20

sobereva 发表于 2023-12-6 02:14
VMD里可以用paperchain风格填充多元环，用比如maxringsize 5 from all选择所有在5元环上的原子，着色可以选 ...

我之前就是用的vmd，但是好像达不到附件的效果，因为colorID似乎不起作用

lyj714 · 发表于 Post on 2023-12-7 12:58:50

本帖最后由 lyj714 于 2023-12-7 13:00 编辑

vmd直接改paperchain样式应该是不能调整颜色的。可以把每个环划分成多个三角形然后用vmd画有颜色的三角形来以此显示环倒是可以，不过对于那种不在一个平面的环就有明显的棱面感不太舒服。总的来说用vmd画出好看的还是比较复杂的

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