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[GROMACS] 求助:关于Merz离子参数的使用

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请问文献中Merz力场参数直接用于Gromacs中是不是就直接把Rmin,M/2(A)乘以2当作amber力场中的sigma,第二个参数乘以4.184当作amber力场中的epsilon就可以了?

Merz 参数.png (44.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 39)

Merz 参数.png

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发表于 Post on 2021-5-15 16:48:41 | 只看该作者 Only view this author

R_min是平衡距离,即下图的r0。而sigma是LJ势作用为0的位置


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-15 20:33:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-15 16:48

R_min是平衡距离,即下图的r0。而sigma是LJ势作用为0的位置

太感谢卢老师了,差点就用错的参数去算了

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发表于 Post on 2022-4-13 17:40:20 | 只看该作者 Only view this author
您好,请问这个Merz的参数在哪可以看到啊

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发表于 Post on 2022-4-13 19:15:34 | 只看该作者 Only view this author
xjw 发表于 2022-4-13 17:40
您好,请问这个Merz的参数在哪可以看到啊

AmberTools21里边有,或者去amber官网找Force Fields的Ion Parameters有介绍

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发表于 Post on 2022-4-13 21:13:30 | 只看该作者 Only view this author
HZW 发表于 2022-4-13 19:15
AmberTools21里边有,或者去amber官网找Force Fields的Ion Parameters有介绍

好的。谢谢哈。

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发表于 Post on 2024-3-10 02:01:00 | 只看该作者 Only view this author
请问epsilon的转化是直接乘以4.184吗?

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