求助：pull中pull-coord1-k计算问题（已解决）

haijiayuan · 发表于 Post on 2023-2-8 10:24:52

本帖最后由 haijiayuan 于 2023-2-8 14:04 编辑

如图所示，想使ab之间产生特定方向（横向）的压力进行md模拟，采用的策略是对ab进行恒力牵引，请问如何将（kJ mol-1 nm-1）换算成ab之间的压力？
；pul com NVT
pull                = yes
pull-pbc-ref-prev-step-com = yes
pull-ngroups       = 2
pull-ncoords       = 1
pull-group1-name    = a
pull-group1-pbcatom = 111
pull-group2-name    = b
pull-group2-pbcatom = 222
pull-coord1-type    = constant-force
pull-coord1-geometry  = direction-periodic
pull-coord1-groups = 1 2
pull-coord1-vec    = 0.0 0.0 -1
pull-coord1-k       = 0.9477367 ；kJ mol-1 nm-1

haijiayuan · 发表于 Post on 2023-2-8 14:22:57

jerkwin的在线计算兼单位换算器可以换算

zyp1999 · 发表于 Post on 2023-3-1 11:28:08

本帖最后由 zyp1999 于 2023-3-1 15:55 编辑

haijiayuan 发表于 2023-2-8 14:22
jerkwin的在线计算兼单位换算器可以换算

这个在线单位换算的话，假如我需要加压150mpa，盒子面积30nm^2，是换算完是270.996吗C:\Users\YT-PC592\Desktop\微信图片_20230301112623.png

haijiayuan · 发表于 Post on 2023-4-11 15:41:01

zyp1999 发表于 2023-3-1 11:28
这个在线单位换算的话，假如我需要加压150mpa，盒子面积30nm^2，是换算完是270.996吗

应该是这样

姜酱将 · 发表于 Post on 2023-12-25 20:33:04

zyp1999 发表于 2023-3-1 11:28
这个在线单位换算的话，假如我需要加压150mpa，盒子面积30nm^2，是换算完是270.996吗

请问一下按照这个换算出来的力你能实现这个压缩的效果吗

zyp1999 · 发表于 Post on 2024-1-2 16:42:40

姜酱将发表于 2023-12-25 20:33
请问一下按照这个换算出来的力你能实现这个压缩的效果吗

我上面说错了，换出来应该是2709.96，然后这样换出来的力是有压缩效果的

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