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[综合交流] 求助计算离子液体和金属阳离子结合能

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我想计算我这个离子液体和Na+的结合能,主要是为了比较1位置的O和2位置的O哪个更容易与我的Na+结合。我的做法是不考虑PF6-,真空下Na+用def2tzvp,其他原子b3lyp,前后能量做差得到我的结合能,但是目前我计算的结果显示E大于0,想请教一下各位老师这个是什么问题,还有就是我这个需要考虑PF6-吗,因为我还有其他带O的离子液体,就是想比较一下各个离子液体与Na+的结合能,不知道加了PF6-会有多大的影响,索性就没加

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发表于 Post on 2023-12-21 04:12:12 | 只看该作者 Only view this author
"真空下Na+用def2tzvp,其他原子b3lyp"  根本不是并列关系。先分清楚基组和理论方法再说,看下文
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html

不考虑PF6-时,两个阳离子相互作用能为正极其正常

没具体输入文件,别人无从判断计算有什么可能的硬伤

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-21 08:49:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-21 04:12
"真空下Na+用def2tzvp,其他原子b3lyp"  根本不是并列关系。先分清楚基组和理论方法再说,看下文
计算化学 ...

谢谢sob老师,我应该是在b3lyp泛函下,Na+用def2tzvp,其他原子6-311+G(d,p)然后是在真空下做的加了em=gd3bj,Na+和我离子液体的结合的计算输入我附在了下面(因为篇幅太长我把原子坐标删除了,我是先用b3lyp优化,在M062X下算的单点能
E(A,离子液体)

# opt freq b3lyp/6-311+g(d,p) em=gd3bj

1 1

E(B,Na+)
# opt freq b3lyp/def2tzvp

Title Card Required

1 1
Na               -11.12041566   -0.09400025    0.00000000


E(AB)
# opt freq b3lyp/genecp em=gd3bj

Title Card Required

2 1

C H O N 0
6-311+g(d,p)
****
Na 0
def2tzvp
****

Na 0
def2tzvp

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发表于 Post on 2023-12-22 01:38:58 | 只看该作者 Only view this author
xiaobai1 发表于 2023-12-21 08:49
谢谢sob老师,我应该是在b3lyp泛函下,Na+用def2tzvp,其他原子6-311+G(d,p)然后是在真空下做的加了em ...

Na单个原子根本没法优化

def2-TZVP本来就是全电子基组,用genecp并且试图定义赝势毫无意义

当前是对两个阳离子算的相互作用能,静电互斥那么强,而且你又没带溶剂模型而是算的真空情况,数值为正极其正常
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-22 08:45:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-22 01:38
Na单个原子根本没法优化

def2-TZVP本来就是全电子基组,用genecp并且试图定义赝势毫无意义

好的sob老师,关于def2-TZVP这个基组我再去查一查资料,sob关于您说的Na单个原子没法优化,那么我在算作用能E(Na+)的这部分时是不是只考虑一个单点能就好了呢

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发表于 Post on 2023-12-22 16:03:25 | 只看该作者 Only view this author
xiaobai1 发表于 2023-12-22 08:45
好的sob老师,关于def2-TZVP这个基组我再去查一查资料,sob关于您说的Na单个原子没法优化,那么我在算作 ...

单个原子可以做振动分析。单原子的平动运动对热力学量也有贡献,振动分析给出的热力学量会考虑到
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