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[综合交流] 如何判断三分子反应如何判断反应是否容易发生

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底物A-H  、  碱与 B反应,产物为A-B , 碱在A,B成键的过程中拔掉A-H上的质子,该反应算三分子反应吗?我在实际计算和优化中加了一个中间体  (A-H----碱)以该中间体反应能垒较低,但是以三个单体来算,能垒27kcal/mol.
所以我有三个疑问:①由A-H与碱形成氢键,该中间体自由能应该降低才对吧,但是计算结果偏高,是泛函和基组选择的原因吗?
                             ②该反应能不能用过渡态-中间体来算能垒?
                             ③有没有计算三分子反应速率的教程?


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发表于 Post on 2024-1-11 16:54:32 | 只看该作者 Only view this author
检查形成氢键的焓是否降低。形成复合物的焓一般是降低的,但因为这个过程熵不利,自由能未必降低,也有可能升高。这也就是为什么并不是随便两个分子都能形成室温下稳定的复合物。
如果确定A-H和碱先形成氢键,再和B反应,那么A-H和碱的复合物应当看作一个分子,也就是这个反应是双分子反应而非三分子反应。两个分子形成非共价复合物,虽然是两个分子,但是在动力学里算作一个分子
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-11 17:12:57 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-11 16:54
检查形成氢键的焓是否降低。形成复合物的焓一般是降低的,但因为这个过程熵不利,自由能未必降低,也有可能 ...

谢谢老师指导

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