做蛋白-配体结合报错Group Protein_UNL在index文件中没有找到

tiny

Group Protein_UNL referenced in the .mdp file was not found in the index file.Group names must match either [moleculetype] names or custom index group names, in which case you must supply an index file to the '-n' option of grompp.以下是我的md.mdp文件以及index文件，请各位老师指点，谢谢

t675210552

输命令的时候加上“-n index.ndx”

tiny

t675210552 发表于 2023-4-17 21:03
输命令的时候加上“-n index.ndx”

谢谢！问题解决了！

长夜梦我

t675210552 发表于 2023-4-17 21:03
输命令的时候加上“-n index.ndx”

您好，我想问一下，我加了-n index.ndx 这个参数，为什么还是会报这种错误。前面的步骤都是按照别人的流程走的

长夜梦我

长夜梦我 发表于 2023-7-7 19:34
您好，我想问一下，我加了-n index.ndx 这个参数，为什么还是会报这种错误。前面的步骤都是按照别人的流 ...

找到错误了。自己偷懒少做了一步，用了人家现成的东西，结果配体现在更新了，少了几个原子

MOI_001

t675210552 发表于 2023-4-17 21:03
输命令的时候加上“-n index.ndx”

你好，我加了之后报了下面的错要怎么解决啊？
Error in user input:
Invalid command-line options
  In command-line option -n
    Option specified multiple times