计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 425|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 请问可以让Multiwfn打印偶极积分到mwfn文件吗?

[复制链接 Copy URL]

300

帖子

6

威望

2711

eV
积分
3131

Level 5 (御坂)

社长,您好。

我最近写了个波函数分析的程序,用来实现组内的相关idea。因为mwfn文件被Multiwfn支持,且有详细的文档,所以该程序从设计之初就是完全是依靠Multiwfn转换出的mwfn文件做分析的。mwfn文件里不仅有轨道系数和密度矩阵,更重要的是还有波函数分析不可或缺的电子积分,用起来非常方便。

不过现在Multiwfn好像只支持打印重叠积分到mwfn文件。目前我有一项工作,需要手搓一个Foster-Boys局域化。这就需要偶极积分了,可是Multiwfn并不打印。我知道Multiwfn是支持将偶极积分以易阅读的格式输出到屏幕上的,那么可不可以冒昧地请社长增加一项功能,使得Multiwfn可以打印偶极积分到mwfn文件?

非常感谢!


3806

帖子

4

威望

7992

eV
积分
11878

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2024-6-27 15:24:02 | 只看该作者 Only view this author
我提醒一个额外的问题,如果你用不同软件同一计算级别的molden文件->mwfn文件,然后做分析,你可能会看到结果各不相同,那不是数值误差。如果你真的一开始用的是molden,那你需要检查一下。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

300

帖子

6

威望

2711

eV
积分
3131

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-27 15:38:21 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2024-6-27 15:24
我提醒一个额外的问题,如果你用不同软件同一计算级别的molden文件->mwfn文件,然后做分析,你可能会看到结 ...

谢谢提醒。molden文件,除了orca赝势导致核电荷数有问题之外,还有什么问题吗?我暂时只转换过fchk成mwfn。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2024-6-28 05:11:57 | 只看该作者 Only view this author





Multiwfn主功能6里专门有选项输出各种积分,只不过不是输出到mwfn文件里,而是输出到单独的文本文件。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

300

帖子

6

威望

2711

eV
积分
3131

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-2 18:57:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-28 05:11
Multiwfn主功能6里专门有选项输出各种积分,只不过不是输出到mwfn文件里,而是输出到单独的文本 ...

谢谢。可是打印出来的矩阵是这种格式的,
  1. 1 2 3 4 5
  2. 1
  3. 2
  4. 3
  5. 4
  6. 5
  7. 6
  8. 7
  9. 8
  10. 9
  11. 10
  12. 6 7 8 9 10
  13. 6
  14. 7
  15. 8
  16. 9
  17. 10
复制代码

高斯也喜欢用这种格式打印矩阵。我很久以前写过读取这种格式的代码,非常折磨,十分别扭。请问有什么简便方法让机器读取这些矩阵吗?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2024-7-2 19:25:23 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2024-7-2 18:57
谢谢。可是打印出来的矩阵是这种格式的,

高斯也喜欢用这种格式打印矩阵。我很久以前写过读取这种格式 ...

看不懂你的意思
这是Multiwfn直接输出的

  1. **************** Electric dipole moment matrix (X component) ****************
  2.              1             2             3             4             5      
  3.      1  3.75851E-018
  4.      2  8.78327E-019  3.75851E-018
  5.      3 -7.27078E-002 -4.96075E-001  0.00000E+000
  6.      4  3.80983E-051  0.00000E+000  0.00000E+000  3.75851E-018
  7.      5  1.81568E-035  2.27653E-034 -1.56739E-017  0.00000E+000  3.75851E-018
  8.      6  6.28723E-019  2.87015E-018 -4.82583E-001  6.66664E-051  0.00000E+000
  9.      7 -1.00190E-002 -3.29090E-001  0.00000E+000 -6.75710E-034  0.00000E+000
  10.      8 -9.15262E-054  4.91970E-051 -6.75710E-034  1.88497E-018  0.00000E+000
  11.      9  1.67732E-035  0.00000E+000  0.00000E+000  0.00000E+000  1.88497E-018
  12.     10  1.36567E-022  0.00000E+000 -6.73666E-001  0.00000E+000  0.00000E+000
  13.     11  1.26029E-019  2.05615E-018 -2.24555E-001  0.00000E+000  9.34335E-037
  14.     12  1.26029E-019  2.05615E-018 -2.24555E-001 -1.06198E-051 -4.58754E-035
  15.     13 -1.75418E-035 -5.61898E-035  0.00000E+000 -3.88942E-001  0.00000E+000
  16. ...略
复制代码


Multiwfn里的util.f90中有subroutine readmatgau可以直接读这种格式的矩阵,可以借用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 10:05 , Processed in 0.193306 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list