TraPPE中CH4的联合原子拓扑信息能否include到oplsaa力场中？

1367 · 发表于 Post on 2024-5-14 20:58:52

各位老师同学好，在读文献的过程中，我发现了一个问题，如下图所示，他提到了溶剂使用的是opls全原子力场，对于气体分子，使用的是TraPPE力场参数，并且关于CH4又是一个联合原子，我不太清楚这两个是怎么联系在一起的？全原子和联合原子按道理不应该是两个概念，应该连用不起来吧。在论坛中，我也看到关于这些气体小分子，最好使用的也是TraPPE力场，但是我想模拟其他在酮类物质里面的溶解度，力场又该如何选取？

ilovelr · 发表于 Post on 2024-5-15 09:09:50

全原子和联合原子联用的蛮多的锕，联合原子不就是一个原子嘛。气体用TraPPE,溶剂用GAFF,TRAPPE,OPLS都可以，文献中有不少这样用的

1367 · 发表于 Post on 2024-5-15 09:40:58

ilovelr 发表于 2024-5-15 09:09
全原子和联合原子联用的蛮多的锕，联合原子不就是一个原子嘛。气体用TraPPE,溶剂用GAFF,TRAPPE,OPLS都可以 ...

好的，多谢

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[GROMACS] TraPPE中CH4的联合原子拓扑信息能否include到oplsaa力场中？

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