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[VASP] 五氧化二钒表面上进行过氧化氢吸附的AIMD模拟时POSCAR设置问题

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楼主
在五氧化二钒的某个表面上进行过氧化氢吸附的AIMD模拟,那么这个结构的POSCAR怎么设置呢?


1. 全部放开,不固定原子
2. 放开表面的上两层原子以及过氧化氢分子,固定表面的下层原子
3. 固定所有表面原子,只放开过氧化氢分子

恳请大佬解惑一下

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发表于 Post on 2024-1-25 04:47:06 | 只看该作者 Only view this author
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-25 22:38:06 | 只看该作者 Only view this author

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-25 23:09:17 | 只看该作者 Only view this author

社长,想再请问一下,盒子大小一定要大到只使用一个gamma点吗?如果原子数不够多,增加K点数量行吗?

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发表于 Post on 2024-1-26 03:14:53 | 只看该作者 Only view this author
XIEH 发表于 2024-1-25 23:09
社长,想再请问一下,盒子大小一定要大到只使用一个gamma点吗?如果原子数不够多,增加K点数量行吗?

做动力学盒子必须足够大,否则被吸附分子会与镜像存在明显虚假相互作用,以及表面结构变化特征可能被虚假的周期性所严重影响,导致吸附行为研究不合理。
在确定了盒子尺寸基础之上,再决定k点多少合适、是否可以只用gamma点。而不是先根据k点的多少来决定盒子,不要本末倒置。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-26 10:26:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-1-26 03:14
做动力学盒子必须足够大,否则被吸附分子会与镜像存在明显虚假相互作用,以及表面结构变化特征可能被虚假 ...

非常感谢您的回复,

我浅显地理解一下:把一个过氧化氢分子放在盒子中间,使它距离每一个边界都是10 Å(或者多大的距离才足够远?),这样子相邻镜像的两个过氧化氢分子就相距20 Å,再对这个盒子做K点收敛性测试确定K点取值。
我这样理解对吗?

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发表于 Post on 2024-1-27 03:55:10 | 只看该作者 Only view this author
XIEH 发表于 2024-1-26 10:26
非常感谢您的回复,

我浅显地理解一下:把一个过氧化氢分子放在盒子中间,使它距离每一个边界都是10 & ...


与镜像相距12-15埃一般就够了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-2 17:02:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-1-27 03:55

与镜像相距12-15埃一般就够了

感谢!

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