关于out文件输出后的体系价态变化问题

johngu111 · 发表于 Post on 2024-2-9 18:38:28

各位老师新年好，我发现自己构建的水合镧系金属离子体系，优化收敛后打开out文件中显示的电荷及价态和初始gjf种设置的不一样是怎么回事呢？是这个体系是不能为+3价？

sobereva · 发表于 Post on 2024-2-9 18:57:30

计算用的输入文件里gjf文件里实际净电荷写的几（不要叫价态，有歧义），Gaussian计算时净电荷就是多少，Gaussian不会随便变化这个。

johngu111 · 发表于 Post on 2024-2-9 20:42:48

sobereva 发表于 2024-2-9 18:57
计算用的输入文件里gjf文件里实际净电荷写的几（不要叫价态，有歧义），Gaussian计算时净电荷就是多少，Gau ...

哦哦，也就是打开out文件里显示的跟自己当时输入的其实没什么关系是吗

ionexchangeC · 发表于 Post on 2024-2-9 22:27:39

如果用大核赝势的话确实可能出现GaussView显示bug，对照输出文件的内容确保计算无误就可以无视

sobereva · 发表于 Post on 2024-2-10 08:18:18

johngu111 发表于 2024-2-9 20:42
哦哦，也就是打开out文件里显示的跟自己当时输入的其实没什么关系是吗

感觉似乎你搞错了什么
直接上传压缩后的输入输出文件

johngu111 · 发表于 Post on 2024-2-10 09:41:24

sobereva 发表于 2024-2-10 08:18
感觉似乎你搞错了什么
直接上传压缩后的输入输出文件

好的，麻烦老师帮忙看看

johngu111 · 发表于 Post on 2024-2-10 09:42:47

ionexchangeC 发表于 2024-2-9 22:27
如果用大核赝势的话确实可能出现GaussView显示bug，对照输出文件的内容确保计算无误就可以无视

好的，谢谢，确实用了大核赝势

sobereva · 发表于 Post on 2024-2-10 20:49:39

johngu111 发表于 2024-2-10 09:41
好的，麻烦老师帮忙看看

你的输出文件和你的输入文件根本不对应

输出文件开头部分显示的输入文件里的内容：
-----------
Ce3+optfreq
-----------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  3 Multiplicity = 1
Ce                   0.04446  -0.00922  -0.14717
O                   -1.82322  -1.28246  -1.3462
O                   1.86278  -0.41132 1.63558
O                   0.93523 2.22071  -1.08976
O                   -1.9797 -0.79552 1.28622
O                   0.40229  -2.51601 0.12441

...

然而你上传的输入文件Ce是最后一个原子

当前计算用的净电荷就是3，这从输出文件里Charge=             3.0000 electrons这一行就能明白。别管gview怎么显示的，识别不对输出文件是常有的事

johngu111 · 发表于 Post on 2024-2-10 23:02:43

sobereva 发表于 2024-2-10 20:49
你的输出文件和你的输入文件根本不对应

输出文件开头部分显示的输入文件里的内容：

好的，明白了，谢谢sob老师，新年快乐！

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