求助：气液界面模拟，进行平衡相模拟时出错

爱迪生

Step 1, time 0.001 (ps)  LINCS WARNING
relative constraint deviation after LINCS:
rms 957.041565, max 48864.703125 (between atoms 8474 and 8506)
bonds that rotated more than 30 degrees:
atom 1 atom 2  angle  previous, current, constraint length
     16     39   90.0    0.3550   0.4480      0.1113
     55     82   90.0    0.1100   4.0516      0.1100
     56     83   90.0    0.1100   3.3980      0.1100
     58     84   42.3    0.1100   0.1100      0.1100
     59     85   90.0    0.1099   0.1192      0.1099
     93    120   34.9    0.1100   0.1100      0.1100
     95    121   31.5    0.1100   0.1100      0.1100
    130    157   60.2    0.1100   0.1100      0.1100
    133    159   30.6    0.1099   0.1099      0.1099
    167    194   35.4    0.1100   0.1100      0.1100
    169    195   33.5    0.1100   0.1100      0.1100
    170    196   60.7    0.1099   0.1099      0.1099
    182    198   36.0    0.0972   0.0972      0.0972
    185    199   35.7    0.0971   0.0971      0.0971
    204    241   34.5    0.1113   0.1113      0.1113
    221    251   49.6    0.1101   0.1101      0.1101
    563    596   47.1    0.1100   0.1100      0.1100
    627    657   40.8    0.1101   0.1101      0.1101
    815    839   54.1    0.0942   0.0942      0.0942
    872    896   40.5    0.0942   0.0942      0.0942
    970   1003   41.2    0.1100   0.1100      0.1100
    976   1006   53.5    0.1100   0.1100      0.1100
   1091   1121   35.0    0.1101   0.1101      0.1101
   1265   1295   90.0    0.1161   0.5375      0.1101
   1266   1296   90.0    0.1100   0.5739      0.1100
   1366   1406   33.2    0.1111   0.1111      0.1113
   1722   1755   90.0    0.1100   0.2099      0.1100
   1723   1756   90.0    0.1357   0.2645      0.1100
   1734   1763   71.4    0.1250   0.1100      0.1100
   2523   2560   33.7    0.1113   0.1113      0.1113
   2524   2561   90.0    0.1113   2.4879      0.1113
   2524   2562   33.4    0.1114   0.1157      0.1114
   2525   2563   56.2    0.1133   0.1067      0.1113
   2525   2564   90.0    0.1399   2.1236      0.1113
   2671   2695   80.2    0.1015   0.0942      0.0942
   2696   2730   50.9    0.1117   0.1112      0.1113
   2729   2753   37.2    0.0942   0.0942      0.0942
   2756   2793   43.5    0.1114   0.1113      0.1113
   2874   2913   40.7    0.1114   0.1114      0.1113
   2999   3032   38.7    0.1100   0.1100      0.1100
   3067   3096   36.2    0.1100   0.1100      0.1100
   3309   3333   46.1    0.0942   0.0942      0.0942
   3474   3503   60.4    0.1100   0.1100      0.1100
   3567   3603   90.0    0.1112   0.1181      0.1112
   3995   4024   38.7    0.1100   0.1100      0.1100
   4005   4029   37.6    0.0942   0.0942      0.0942
   4059   4088   45.2    0.1112   0.1113      0.1114
   4118   4147   90.0    0.1114   0.3100      0.1113
   4118   4148   90.0    0.1113   2.0013      0.1113
   4119   4149   90.0    0.1149   2.1137      0.0942
   4390   4420   90.0    0.1112   0.3357      0.1112
   4390   4421   90.0    0.1113   2.4997      0.1113
   4391   4422   90.0    0.1115   2.5458      0.0942
   4437   4468   90.0    0.1344   3.7374      0.1113
   4438   4469   90.0    0.1113   8.2046      0.1113
   4439   4470   90.0    0.1463   0.1204      0.1113
   4453   4483   30.7    0.0942   0.0942      0.0942
   4575   4605   90.0    0.1427   4.8581      0.1113
   4583   4613   90.0    0.0943   0.9422      0.0943
   4842   4869   52.9    0.1083   0.1180      0.1112
   4842   4870   90.0    0.4864   0.1444      0.1113
   4842   4871   38.5    0.1081   0.1144      0.1113
   4897   4924   90.0    0.1084   0.3612      0.1112
   4897   4925  152.5    0.4633 4599.6035      0.1113
   4897   4926   90.0    0.1081   0.1813      0.1113
   4952   4979   90.0    0.1083   0.3665      0.1112
   4952   4980   90.0    0.4702   1.6553      0.1113
   4952   4981   90.0    0.1082   0.2074      0.1113
   4987   5010   90.0    0.1116   0.1396      0.1113
   4987   5011   90.0    0.1247   1.6792      0.1113
   4987   5012   90.0    0.1116   0.1256      0.1113
   4988   5013   90.0    0.1113   0.1748      0.1113
   4988   5014   90.0    0.1114   1.4629      0.1114
   5007   5034   90.0    0.1091   0.2933      0.1112
   5007   5036   90.0    0.1081   0.1671      0.1113
   5062   5089   41.7    0.1085   0.1159      0.1112
   5062   5090   83.2    0.4605   0.1113      0.1113
   5062   5091   31.9    0.1083   0.1133      0.1113
   5117   5144   47.0    0.1082   0.1168      0.1112
   5117   5145   90.0    0.4657   0.8251      0.1113
   5117   5146   33.0    0.1083   0.1137      0.1113
   5118   5147   70.0    0.1198   0.1114      0.1112
   5172   5199   90.0    0.1084   0.2844      0.1112
   5172   5200   90.0    0.4558   1.8975      0.1113
   5172   5201   90.0    0.1083   0.1669      0.1113
   5227   5254   57.5    0.1083   0.1186      0.1112
   5227   5255   90.0    0.4886   0.5276      0.1113
   5227   5256   40.0    0.1081   0.1149      0.1113
   5282   5309   90.0    0.1084   0.3748      0.1112
   5282   5310   90.0    0.4669   3.8286      0.1113
   5282   5311   90.0    0.1083   0.2150      0.1113
   5284   5316   45.2    0.1113   0.1114      0.1114
   5337   5364   65.3    0.1086   0.1195      0.1112
   5337   5365   90.0    0.4430   0.7628      0.1113
   5337   5366   40.3    0.1084   0.1158      0.1113
   5392   5419   44.1    0.1083   0.1157      0.1112
   5392   5420   78.4    0.4805   0.1114      0.1113
   5392   5421   33.9    0.1082   0.1133      0.1113
   5427   5451   30.7    0.1113   0.1113      0.1113
   5442   5469   33.5    0.0972   0.0972      0.0972
   5447   5474   41.7    0.1085   0.1145      0.1112
   5447   5475   65.0    0.4525   0.1110      0.1113
   5447   5476   31.6    0.1083   0.1128      0.1113
   5502   5529   43.0    0.1084   0.1154      0.1112
   5502   5530   74.9    0.4575   0.1114      0.1113
   5502   5531   34.4    0.1082   0.1133      0.1113
   5557   5584   43.0    0.1093   0.1162      0.1112
   5557   5585   77.3    0.4521   0.1111      0.1113
   5557   5586   38.5    0.1084   0.1141      0.1113
   5612   5639   46.3    0.1082   0.1170      0.1112
   5612   5640   90.0    0.4911   0.1117      0.1113
   5612   5641   36.4    0.1081   0.1138      0.1113
   5667   5694   44.0    0.1083   0.1155      0.1112
   5667   5695   75.5    0.4809   0.1112      0.1113
   5667   5696   34.3    0.1081   0.1132      0.1113
   5722   5749   38.8    0.1086   0.1152      0.1112
   5722   5750   78.1    0.4378   0.1113      0.1113
   5722   5751   33.2    0.1083   0.1131      0.1113
   5777   5804   42.1    0.1084   0.1147      0.1112
   5777   5805   67.1    0.4678   0.1115      0.1113
   5777   5806   31.8    0.1082   0.1128      0.1113
   5832   5859   90.0    0.1083   0.1369      0.1112
   5832   5860   90.0    0.4705   1.2579      0.1113
   5832   5861   51.8    0.1082   0.1190      0.1113
   5887   5914   90.0    0.1082   0.3165      0.1112
   5887   5915   90.0    0.4913   3.8584      0.1113
   5887   5916   90.0    0.1081   0.1618      0.1113
   5942   5969   90.0    0.1082   0.2232      0.1112
   5942   5970   90.0    0.4732   2.8321      0.1113
   5942   5971   90.0    0.1079   0.1376      0.1113
   5997   6024   43.8    0.1084   0.1177      0.1112
   5997   6025   90.0    0.4841   0.1114      0.1113
   5997   6026   60.3    0.1089   0.1175      0.1113
   6052   6079   43.1    0.1083   0.1156      0.1112
   6052   6080   77.5    0.4677   0.1114      0.1113
   6052   6081   34.0    0.1081   0.1133      0.1113
   6107   6134   90.0    0.1083   0.1839      0.1112
   6107   6135  130.9    0.4822  72.6448      0.1113
   6107   6136   68.8    0.1082   0.1009      0.1113
   6162   6189   43.0    0.1083   0.1165      0.1112
   6162   6190   90.0    0.4783   0.2361      0.1113
   6162   6191   33.3    0.1082   0.1136      0.1113
   6217   6244   90.0    0.1086   0.2404      0.1112
   6217   6245  109.5    0.4322 2096.0776      0.1113
   6217   6246   90.0    0.1084   0.1406      0.1113
   6272   6299   41.7    0.1084   0.1164      0.1112
   6272   6300   90.0    0.4649   0.3517      0.1113
   6272   6301   32.7    0.1082   0.1135      0.1113
   6327   6354   45.2    0.1083   0.1169      0.1112
   6327   6355   90.0    0.4987   0.1229      0.1113
   6327   6356   36.0    0.1081   0.1138      0.1113
   6382   6409   36.6    0.1085   0.1155      0.1112
   6382   6410   88.9    0.4489   0.1101      0.1113
   6437   6464   90.0    0.1084   0.1767      0.1112
   6437   6465   90.0    0.4591   1.4478      0.1113
   6437   6466   67.4    0.1083   0.1212      0.1113
   6492   6519   45.6    0.1086   0.1170      0.1112
   6492   6520   90.0    0.4340   0.2272      0.1113
   6492   6521   32.3    0.1084   0.1138      0.1113
   6527   6550   90.0    0.1113   0.1174      0.1113
   6527   6551   90.0    0.1113   0.1436      0.1113
   6527   6552   90.0    0.1113   3.7225      0.1113
   6547   6574   41.9    0.1084   0.1164      0.1112
   6547   6575   90.0    0.4588   0.1128      0.1113
   6547   6576   32.5    0.1083   0.1136      0.1113
   6602   6629   90.0    0.1086   0.3651      0.1112
   6602   6630  102.7    0.4451 1941.4351      0.1113
   6602   6631   90.0    0.1081   0.1822      0.1113
   6657   6684   39.9    0.1084   0.1154      0.1112
   6657   6685   81.2    0.4621   0.1116      0.1113
   6657   6686   31.9    0.1082   0.1131      0.1113
   6712   6739   90.0    0.1082   0.1909      0.1112
   6712   6740   90.0    0.4933   3.9126      0.1113
   6712   6741   83.4    0.1080   0.1216      0.1113
   6747   6770   35.4    0.1114   0.1114      0.1113
   6748   6773   34.0    0.1113   0.1113      0.1113
   6767   6794   34.4    0.1085   0.1069      0.1112
   6818   6845   38.4    0.0942   0.0942      0.0942
   6822   6849   40.3    0.1084   0.1162      0.1112
   6822   6850   90.0    0.4577   0.2962      0.1113
   6822   6851   31.3    0.1083   0.1134      0.1113
   6877   6904   39.4    0.1085   0.1154      0.1112
   6877   6905   80.5    0.4441   0.1112      0.1113
   6877   6906   30.1    0.1088   0.1135      0.1113
   6912   6935   39.6    0.1113   0.1113      0.1113
   6923   6952   30.8    0.1113   0.1112      0.1112
   6932   6959   44.3    0.1083   0.1167      0.1112
   6932   6960   90.0    0.4751   0.1114      0.1113
   6932   6961   34.4    0.1081   0.1137      0.1113
   6934   6964   56.4    0.1113   0.1113      0.1113
   6984   7011   90.0    0.0968   0.0957      0.0942
   6987   7014   90.0    0.1081   0.1711      0.1112
   6987   7015   90.0    0.4960   0.8014      0.1113
   6987   7016   67.7    0.1080   0.1204      0.1113
   7042   7070   90.0    0.4569   0.7017      0.1113
   7077   7102   71.4    0.1240   0.1113      0.1113
   7092   7119   44.9    0.0972   0.0972      0.0972
   7095   7122   30.1    0.0941   0.0941      0.0941
   7097   7124   36.5    0.1090   0.1154      0.1112
   7097   7125   78.0    0.5036   0.1112      0.1113
   7097   7126   35.7    0.1079   0.1132      0.1113
   7164   7194   30.3    0.1113   0.1113      0.1113
   7290   7320   30.7    0.1113   0.1113      0.1113
   7447   7480   50.1    0.1113   0.1113      0.1112
   7479   7509   30.3    0.1113   0.1113      0.1113
   7585   7617   33.6    0.1114   0.1114      0.1114
   7605   7635   31.1    0.1113   0.1113      0.1113
   7857   7887   32.0    0.1113   0.1113      0.1113
   8094   8124   64.1    0.1111   0.1113      0.1112
   8216   8248   35.9    0.1112   0.1112      0.1112
   8231   8260   90.0    0.1113   0.1217      0.1113
   8235   8265   33.1    0.1116   0.1112      0.1113
   8474   8506  132.0    0.0942 4601.7324      0.0942
   8487   8517   30.4    0.1113   0.1113      0.1113
   8535   8565   58.9    0.1114   0.1112      0.1112
   8550   8580   30.5    0.1113   0.1113      0.1113
   8613   8643   30.3    0.1113   0.1113      0.1113
   8644   8678   50.8    0.1114   0.1114      0.1114
   8739   8769   33.3    0.1113   0.1113      0.1113
   8788   8820   37.8    0.1113   0.1113      0.1113
   8802   8832   32.3    0.1113   0.1113      0.1113
   8833   8866   49.3    0.1112   0.1113      0.1112
   9027   9060   36.2    0.1112   0.1112      0.1112
   9054   9084   30.2    0.1113   0.1113      0.1113
   9117   9146   36.4    0.1118   0.1117      0.1113
   9117   9147   30.7    0.1104   0.1106      0.1113
   9227   9257   69.9    0.1283   0.1012      0.1012
   9231   9263   30.9    0.1020   0.1020      0.1020
   9306   9336   31.5    0.1113   0.1113      0.1113
   9495   9525   30.4    0.1113   0.1113      0.1113
   9558   9588   30.9    0.1113   0.1113      0.1113
   9684   9714   31.4    0.1113   0.1113      0.1113
   9921   9952   32.3    0.1113   0.1113      0.1113
   9967  10002   39.1    0.1114   0.1114      0.1113
   9979  10011   31.8    0.1114   0.1114      0.1114
   9999  10029   30.9    0.1113   0.1113      0.1113
  10062  10092   30.8    0.1113   0.1113      0.1113
  10125  10155   90.0    0.1111   0.1821      0.1113
  10251  10281   30.6    0.1113   0.1113      0.1113
  10314  10344   30.9    0.1113   0.1113      0.1113
  10345  10379   35.9    0.1118   0.1114      0.1114
  10552  10584   90.0    0.1113   0.1570      0.1113
  10553  10585   34.5    0.0942   0.0942      0.0942
  10629  10659   30.8    0.1113   0.1113      0.1113
  10692  10722   31.6    0.1116   0.1114      0.1113
  10755  10785   30.3    0.1113   0.1113      0.1113
  11300  11329   44.4    0.1117   0.1114      0.1114

step 1: One or more water molecules can not be settled.
Check for bad contacts and/or reduce the timestep if appropriate.
Wrote pdb files with previous and current coordinates

这是啥问题呀，各位大佬。

sobereva

itp都没给，别人没法判断
照着http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8检查和调试