请教为什么SMD模拟过程中周期性边界条件会变化？

爱人只爱辣辣米 · 发表于 Post on 2024-2-21 21:59:05

各位老师同学大家好，我想请教一下为什么模拟过程中周期性边界条件会变化？
平衡时候的边界稳定为长方形，加上SMD后就变成正方形了呢

Yaozhi_Yang · 发表于 Post on 2024-2-22 13:32:00

你控压了吧？

爱人只爱辣辣米 · 发表于 Post on 2024-2-22 14:01:55

Yaozhi_Yang 发表于 2024-2-22 13:32
你控压了吧？

是的，我用的是NPT系综

，谢谢提醒

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[NAMD] 请教为什么SMD模拟过程中周期性边界条件会变化？