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[VMD] 求助如何利用vmd构建银原子棒

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各位前辈,教程里的vmd里的Modeling可以构建金原子棒,但我想研究银原子棒的话,请问如何操作才能构建银原子棒呢?好像没有银原子的选项。

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发表于 Post on 2024-3-1 02:01:46 | 只看该作者 Only view this author
产生结构后,自己把Au替换成Ag,然后做结构优化使得原子间距变合理
要么就用Ag的cif文件构造足够大的超胞,在VMD里用恰当的选择语句挖出一个柱形区域
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-1 11:10:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-1 02:01
产生结构后,自己把Au替换成Ag,然后做结构优化使得原子间距变合理
要么就用Ag的cif文件构造足够大的超胞 ...

请问老师结构优化该怎么优化呢

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发表于 Post on 2024-3-1 12:00:37 | 只看该作者 Only view this author
duzy 发表于 2024-3-1 11:10
请问老师结构优化该怎么优化呢

Au的力场参数改成Ag的参数,MD软件做能量极小化

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