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[Multiwfn使用咨询] ELF盆分析可视化问题

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请教sob老师及各位专家,我在使用Multiwfn进行ELF盆分析时(为了分析两个金属之间的共价相互作用),随后想将盆分析可视化,按照手册里4.17.10的例子进行(由于体系较大,只需要两个金属上的盆,故只选择了结果里的V(M1,M2)),但发现在VMD里面输入source basinsyn.vmd后会运行一小会儿就直接闪退,所以想请教下这个问题在哪儿?

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发表于 Post on 2024-3-4 11:05:21 | 只看该作者 Only view this author
内存不够?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-4 11:14:15 | 只看该作者 Only view this author
您好,我不太知道这个VMD可视化也需要内存?
刚才用4.17.10最后改变颜色的例子发现可以可视化,但上面用脚本的就不行

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发表于 Post on 2024-3-4 11:20:33 | 只看该作者 Only view this author
NB的随风 发表于 2024-3-4 11:14
您好,我不太知道这个VMD可视化也需要内存?
刚才用4.17.10最后改变颜色的例子发现可以可视化,但上面用脚 ...

抱歉,看错了,我以为是Multiwfn闪退

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发表于 Post on 2024-3-4 12:05:36 | 只看该作者 Only view this author
如果cube文件较大,比如几百兆甚至更大,确保用的VMD 64bit版本
或者Multiwfn盆分析的时候把盒子只框在感兴趣的区域,避免格点数太多
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-4 13:34:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-4 12:05
如果cube文件较大,比如几百兆甚至更大,确保用的VMD 64bit版本
或者Multiwfn盆分析的时候把盒子只框在感 ...

sob老师,您好!
本人也是头一次接触盆分析,您说的只框感兴趣的区域具体怎么操作,有例子吗

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发表于 Post on 2024-3-5 02:12:15 | 只看该作者 Only view this author
NB的随风 发表于 2024-3-4 13:34
sob老师,您好!
本人也是头一次接触盆分析,您说的只框感兴趣的区域具体怎么操作,有例子吗

Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452
看Q39
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-5 20:07:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-5 02:12
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452
看Q39

非常感谢sob老师的回复!

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