计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 4023|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 计算振动分辨的电子光谱的一些疑问

[复制链接 Copy URL]

8

帖子

0

威望

540

eV
积分
548

Level 4 (黑子)

各位老师好,我参照sob的振动分辨的电子光谱的计算(http://sobereva.com/223)与科音帖子学习如何计算振动分辨的电子光谱及一些疑问http://bbs.keinsci.com/thread-774-1-1.html),尝试了振动光谱的计算,其中在输入文件中加入额外参数的命令行后,sob的案例会出现 “Data for initial state taken from checkpoint file "noreli00 specmin=16670 specmax=28570 specres=16 SPECHWHM=300"  Error termination in NtrErr:”的报错,而后者科音帖子可以正常计算,想问是什么导致前者的报错。均使用G09D计算,两者区别只是计算分子的不同,还有读取的激发态振动分析的chk文件不同。这是按照sob帖子写的输入文件

这是对应的输出文件(报错)

这是按照后者帖子写的输入文件

这是后者输出文件 (正确)

可以看到前者在log文件里没有读取“Parameters for vibronic calculations”的步骤,错把加入的额外参数读成了chk文件,所以导致报错。但是不明白是什么导致的?
这是我计算的原始文件 anisole_FCem_H300.gjf (1.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)




anisole_FCem_H300.log (171.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

FCem_3.gjf (857 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2)

FCem_3.log (91.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)


5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112378

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2022-2-7 02:08:38 | 只看该作者 Only view this author
如果是在windows下创建的输入文件而在linux下运行的,dos2unix转换一下输入文件,然后在Linux下面看末尾部分的格式是否正常,正常的话重新运行再试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

8

帖子

0

威望

540

eV
积分
548

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-7 09:52:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-2-7 02:08
如果是在windows下创建的输入文件而在linux下运行的,dos2unix转换一下输入文件,然后在Linux下面看末尾部 ...

感谢sob老师解答。不过尝试后,确定输入文件已经是linux格式,内容正常,计算后仍是出现同样报错

8

帖子

0

威望

540

eV
积分
548

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-12 15:18:56 | 只看该作者 Only view this author
感谢某量化群“paramecium86”大佬的解答  其实问题很简单。不能opt+freq一起写  opt会把freq后面加的关键词给覆盖掉。可以先opt 最后在进行freq加上相应关键词

9

帖子

0

威望

41

eV
积分
50

Level 2 能力者

5#
发表于 Post on 2024-1-26 21:55:19 | 只看该作者 Only view this author
Jacob 发表于 2022-2-12 15:18
感谢某量化群“paramecium86”大佬的解答  其实问题很简单。不能opt+freq一起写  opt会把freq后面加的关键 ...

老师,您这个可以再解释详细点吗

9

帖子

0

威望

41

eV
积分
50

Level 2 能力者

6#
发表于 Post on 2024-2-4 19:41:04 | 只看该作者 Only view this author
Jacob 发表于 2022-2-12 15:18
感谢某量化群“paramecium86”大佬的解答  其实问题很简单。不能opt+freq一起写  opt会把freq后面加的关键 ...

老师,意思是先进行opt 优化构型后,再重新提交一个任务进行freq计算吗

8

帖子

0

威望

540

eV
积分
548

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-7 17:32:06 | 只看该作者 Only view this author
Lichuan 发表于 2024-2-4 19:41
老师,意思是先进行opt 优化构型后,再重新提交一个任务进行freq计算吗

是的 单独做个opt任务 然后再基于opt的结构做freq

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 07:14 , Processed in 0.194126 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list