想使用Multiwfn展示交联结构的孔洞，但MS导出pdb格式后发现周期性缺失该怎么办？

cll · 发表于 Post on 2024-3-11 19:38:27

本帖最后由 cll 于 2024-3-11 19:53 编辑

使用MS进行大分子交联后，得到周期性交联结构，想使用Multiwfn展实孔洞，但在MS中将结构导出为pdb格式后，周期性消失，请问该怎么办？
导出的pdb格式，以及原始结构请看附件

sobereva · 发表于 Post on 2024-3-12 10:38:15

周期性并没有缺失。pdb文件里有CRYST1字段记录了盒子信息，载入Multiwfn后在主功能0里也能看到盒子

如果是想把原子都卷入盒子里，用下文提到的功能
Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍
http://sobereva.com/610（http://bbs.keinsci.com/thread-24674-1-1.html）

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