求教OPLS立场怎么用呢?

艾尔斯灿 · 发表于 Post on 2024-4-5 10:53:46

本帖最后由艾尔斯灿于 2024-4-5 12:09 编辑

老师让我换成OPLS立场,之前使用的都是GAFF立场.

第一次听说OPLS立场,完全不会用,请问相关指令或者.....有教程什么的吗?

OPLS-AA/M力场（是目前gmx自带的OPLS-AA/L改进版，也是OPLS原作者搞的最新版本）：http://zarbi.chem.yale.edu/oplsaam.html

上面这个链接打不开

喵星大佬 · 发表于 Post on 2024-4-5 11:17:55

你问题问的都莫名其妙

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-5 17:04:31

连程序都不先说清楚，问什么呢
好好看下文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

那叫力场不叫立场，居然一次都写不对

网址访问不了说明链接挂了，大概率只是暂时的。如果是指GROMACS，压缩包直接解压到top目录下用就完了。北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）里我也专门讲了怎么用，培训里也直接给了压缩包

如果这还不明白，说明亟需通过培训好好把gromacs系统学一遍

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