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[VMD] 使用vmd插件计算空间分布函数时遇到问题

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本帖最后由 ngaoo 于 2024-5-8 09:42 编辑

老师,这是我用volmape插件分析的中心分子(A)周围两个分子(B,C)的分布情况,不同颜色代表不同的分子,请问老师这样能说明这两种分子的空间分布问题吗?
1. A分子的isovalue为0.07,占的等值面面积为橙色的部分,B分子的isovalue为0.04,占的等值面面积为紫色的部分
可以根据不同isovalue值对应的等值面面积的大小说明分子的分布情况吗?等值面面积越大分布越多吗?

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发表于 Post on 2024-4-8 03:01:16 | 只看该作者 Only view this author
能说明分布情况

面积不能说明分布多少。空间分布函数的全空间积分值是粒子总数,从这个角度理解等值面图的含义
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-8 09:07:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-8 03:01
能说明分布情况

面积不能说明分布多少。空间分布函数的全空间积分值是粒子总数,从这个角度理解等值面图 ...

谢谢老师

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