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[Sobtop] 羟基化SIO2后H原子不被识别

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各位老师,我刚学习GROMACS不久,想通过sobtop创建top文件,我的模型是一个羟基化后的SIO2球模型,但是sobtop无法识别H原子,麻烦各位老师指点一二,感激!

SiO2.rar

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发表于 Post on 2024-4-8 03:19:40 | 只看该作者 Only view this author
我这里sobtop全都识别了



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-8 12:02:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-8 03:19
我这里sobtop全都识别了

感谢sob老师,我找到问题原因了,因为我把assign_AT.dat文件没有放在sobtop程序的目录里所以导致无法识别。

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